Emergence of Cryptococcus gattii—Pacific Northwest, 2004–2010
Notice bibliographique
Résumé
Cryptococcus is a genus of fungi, of which two species, Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii, cause nearly all human and animal cryptococcal infections. Whereas C. neoformans primarily affects persons infected with human immunodefi ciency virus (HIV) worldwide, C. gattii primarily affects HIV-uninfected persons in tropical and subtropical regions (1). In December 2004, a case of human C. gattii infection was reported in Oregon, associated with an outbreak on Vancouver Island and in mainland British Columbia, Canada (2). A second C. gattii case was reported in Oregon in 2005, and 12 more cases were reported in 2006 and 2007. In 2008, in response to the emergence of C. gattii in the United States, CDC, state and local public health authorities, and the British Columbia Centre for Disease Control (BCCDC) formed the Cryptococcus gattii Public Health Working Group (1). States began collecting epidemiologic information on patients and sending isolates to CDC. By July 2010, a total of 60 human cases had been reported to CDC from four states (California, Idaho, Oregon, and Washington) in the Pacifi c Northwest. Among 52 patients for whom travel history was known, 46 (88%) said they had not traveled to British Columbia or any other C. gattii-endemic areas, suggesting they acquired the infection locally. Among 45 patients with known outcomes, nine (20%) died because of C. gattii infection, and six (13%) died with C. gattii infection. Physicians should consider C. gattii as a possible etiology of a cryptococcal infection among persons living in or traveling to the Pacifi c Northwest or traveling to other C. gattii-endemic areas. Multilocus sequence typing subcategorizes C. gattii into four genotypes: VGI, VGII, VGIII, and VGIV. Further genetic analysis divides the VGII genotype into three subtypes: VGIIa, VGIIb, and VGIIc (3). Although VGII is the genotype most commonly associated with the outbreak in the United States and British Columbia, it is uncommon in other C. gattii-endemic parts of the world, where VGI is isolated most frequently (3). During 1999, C. gattii began appearing in animals and humans on Vancouver Island and, beginning in 2004,
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».