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Enregistrement W4300017409 · doi:10.17615/p324-y636

Isoform-Specific Upregulation of Palladin in Human and Murine Pancreas Tumors

2020· article· en· W4300017409 sur OpenAlexfundno aff
Edna Cukierman, David J. Bentrem, Christopher A. McCulloch, Carol Otey, Jen Jen Yeh, Han Jo Kim, Leigh B. Thorne, Silvia M. Goicoechea, David W. Cowan, Keith E. Volmar, Teresa A. Brentnall, Brian K. Bednarski, Anil K. Rustgi, Steven N. Hochwald, Christianna Stack, Rosa F. Hwang, Sunil R. Hingorani

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGillings School of Public HealthFox Chase Cancer CenterNational Cancer InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillNational Institutes of HealthCenter for Gastrointestinal Biology and Disease, School of Medicine, University of North Carolina at Chapel HillBarts and The London School of Medicine and DentistryPancreatic Cancer Action Network
Mots-clésGene isoformDownregulation and upregulationPancreasPathologyBiologyCell biologyMedicineEndocrinologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA) is a lethal disease with a characteristic pattern of early metastasis, which is driving a search for biomarkers that can be used to detect the cancer at an early stage. Recently, the actin-associated protein palladin was identified as a candidate biomarker when it was shown that palladin is mutated in a rare inherited form of PDA, and overexpressed in many sporadic pancreas tumors and premalignant precursors. In this study, we analyzed the expression of palladin isoforms in murine and human PDA and explored palladin's potential use in diagnosing PDA. We performed immunohistochemistry and immunoblot analyses on patient samples and tumor-derived cells using an isoform-selective monoclonal antibody and a pan-palladin polyclonal antibody. Immunoblot and real-time quantitative reverse transcription-PCR were used to quantify palladin mRNA levels in human samples. We show that there are two major palladin isoforms expressed in pancreas: 65 and 85–90 kDa. The 65 kDa isoform is expressed in both normal and neoplastic ductal epithelial cells. The 85–90 kDa palladin isoform is highly overexpressed in tumor-associated fibroblasts (TAFs) in both primary and metastatic tumors compared to normal pancreas, in samples obtained from either human patients or genetically engineered mice. In tumor-derived cultured cells, expression of palladin isoforms follows cell-type specific patterns, with the 85–90 kDa isoform in TAFs, and the 65 kDa isoform predominating in normal and neoplastic epithelial cells. These results suggest that upregulation of 85–90 kDa palladin isoform may play a role in the establishment of the TAF phenotype, and thus in the formation of a desmoplastic tumor microenvironment. Thus, palladin may have a potential use in the early diagnosis of PDA and may have much broader significance in understanding metastatic behavior.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,325

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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Résumé présentoui

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