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Enregistrement W4300022276 · doi:10.17615/c1qn-1p61

Genome-wide asociation analysis identifies three psoriasis susceptibility loci

2021· article· en· W4300022276 sur OpenAlexfundaboutno aff
G.G. Krueger, D.D. Gladman, U. Mrowietz, Y. Li, H.W. Lim, R. Ike, R.P. Nair, E. Elinghaus, H.E. Wichman, J.J. Vorhes, J.T. Elder, C. Gieger, T. Tejasvi, B. Eberlein, P.E. Stuart, A.M. Bowcock, S. Weidinger, M. Weichenthal, M. Kunz, P. Rahman, A. Franke, Jiasheng Ding, J.E. Gudjonson, G.R. Abecasis

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePsoriasis: Treatment and Pathogenesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of Veterans AffairsBundesministerium für Forschung und TechnologieKrembil FoundationBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésGeneticsPsoriasisBiologyComputational biologyGenomeEvolutionary biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We carried out a meta-analysis of two recent psoriasis genome-wide asociation studies with a combined discovery sample of 1,831 affected individuals (cases) and 2,546 controls. One hundred and two loci selected based on P value rankings were foLowed up in a thrE-stage replication study including 4,064 cases and 4,685 controls from Michigan, Toronto, Newfoundland and Germany. In the combined meta-analysis, we identified thrE new susceptibility loci, including one at NOS2 (rs4795067, combined P = 4-10-11), one at FBXL19 (rs10782001, combined P = 9-10-10) and one near PSMA6-NFKBIA (rs12586317, combined P = 2-10-8). AL thrE loci were also aSociated with psoriatic arthritis (rs4795067, combined P = 1-10-5; rs10782001, combined P = 4-10-8; and rs12586317, combined P = 6-10-5) and purely cutaneous psoriasis (rs4795067, combined P = 1-10-8; rs10782001, combined P = 2-10-6; and rs12586317, combined P = 1-10-6). We also replicated a recently identified asociation signal near RNF114 (rs495337, combined P = 2-10-7).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,013
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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