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Enregistrement W4300062425

Dominant and recessive genetic models of LSP1 Gene rs3817198 Polymorphism and Breast Cancer Risk: A Systematic Review and Meta-analysis Study

2018· review· en· W4300062425 sur OpenAlexaff
Seyed Alireza Mosavi Jarrahi

Notice bibliographique

RevueDOAJ (DOAJ: Directory of Open Access Journals) · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeta-analysisBreast cancerGenetic modelMedicineGeneticsGeneOncologyBiologyBioinformaticsInternal medicineCancer
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: The aim of this meta-analysis is to predict effect of dominant and recessive genetic models of LSP1 gene rs3817198 polymorphism and breast cancer risk. We performed the meta-analysis according to PRISMA protocol. Three databases including PubMed/Medline, Web of sciences and EMBASE was searched. We included all studies that evaluated association of LSP1 gene rs3817198 and breast cancer risk in this meta-analysis. ORs and their reported 95% confidence interval (CI) for dominant and recessive inheritance models were extracted form final retrieved studies. ORs were pooled using both fixed and the random-effect models. Egger’s test and contour-enhanced funnel plot was used to evaluate Publication bias and small study effect. Twelve publications were eligible for final analysis after applying of inclusion and exclusion criteria. Totally, this meta-analysis composed of 15,530 cases and 20,258 controls. This study revealed significant association between LSP1 gene rs3817198 polymorphism and breast cancer in dominant genetic model (OR=1.07 [1.01-1.14]). Inversely, no association was found in recessive genetic model (OR=1.10 [0.93-1.32]). Subgroup analysis displayed a significant association in population-based studies and European & American & African population only in dominant genetic model. Begg’s funnel plot and Egger’s test were used for assessment of publication bias and confirmed no publication bias. Finally, we think LSP1 gene rs3817198 polymorphism is associated with breast cancer risk and the risk is more prominent in Caucasians. Nevertheless, further studies are required to confirm the association.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,092

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0180,047
Bibliométrie0,0070,008
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,227
Tête enseignante GPT0,531
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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