MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4300227976 · doi:10.17615/6423-q968

Leukaemic transformation by CALM–AF10 involves upregulation of Hoxa5 by hDOT1L

2020· article· en· W4300227976 sur OpenAlexfundno aff
Lishan Su, Margot Lemieux, Qi Jiang, Lucie Jeannotte, Yuki Okada, Yi Zhang

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institutes of HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésDownregulation and upregulationTransformation (genetics)Computer scienceBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosomal translocation is a common cause of leukaemia1 and the most common chromosome translocations found in leukaemia patients involve the mixed lineage leukaemia (MLL) gene2,3. AF10 is one of more than 30 MLL fusion partners in leukaemia4. We have recently demonstrated that the H3K79 methyltransferase hDOT1L contributes to MLL–AF10-mediated leukaemogenesis through its interaction with AF10 (ref. 5). In addition to MLL, AF10 has also been reported to fuse to CALM (clathrin-assembly protein-like lymphoid–myeloid) in patients with T-cell acute lymphoblastic leukaemia (T-ALL) and acute myeloid leukaemia (AML)6,7. Here, we analysed the molecular mechanism of leukaemogenesis by CALM–AF10. We demonstrate that CALM–AF10 fusion is both necessary and sufficient for leukaemic transformation. Additionally, we provide evidence that hDOT1L has an important role in the transformation process. hDOT1L contributes to CALM–AF10-mediated leukaemic transformation by preventing nuclear export of CALM–AF10 and by upregulating the Hoxa5 gene through H3K79 methylation. Thus, our study establishes CALM–AF10 fusion as a cause of leukaemia and reveals that mistargeting of hDOT1L and upregulation of Hoxa5 through H3K79 methylation is the underlying mechanism behind leukaemia caused by CALM–AF10 fusion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueUNC LibrariesMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207