Molecular Characterization and In Silico Analyses of Maurolipin Structure as a Secretory Phospholipase <a:math xmlns:a="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"> <a:msub> <a:mrow> <a:mi>A</a:mi> </a:mrow> <a:mrow> <a:mn>2</a:mn> </a:mrow> </a:msub> </a:math> (<c:math xmlns:c="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"> <c:msub> <c:mrow> <c:mtext>sPLA</c:mtext> </c:mrow> <c:mrow> <c:mn>2</c:mn> </c:mrow> </c:msub> </c:math>) from Venom Glands of Iranian Scorpio maurus (Arachnida: Scorpionida)
Notice bibliographique
Résumé
The venom is a mixture of various compounds with specific biological activities, such as the phospholipase A 2 ( PLA 2 ) enzyme present in scorpion venom. PLA 2 plays a key role in inhibiting ryanodine receptor channels and has neurotoxic activity. This study is the first investigation of molecular characterization, cloning, and in silico analyses of PLA 2 from Iranian Scorpio maurus, named Maurolipin. After RNA extraction from S. maurus venom glands, cDNA was synthesized and amplified through RT-PCR using specific primers. Amplified Maurolipin was cloned in TA cloning vector, pTG19. For in silico analyses, the characterized gene was analyzed utilizing different software. Maurolipin coding gene with 432 base pair nucleotide length encoded a protein of 144 amino acid residues and 16.34 kilodaltons. Comparing the coding sequence of Maurolipin with other characterized PLA 2 from different species of scorpions showed that this protein was a member of the PLA 2 superfamily. According to SWISS-MODEL prediction, Maurolipin had 38.83% identity with bee venom PLA 2 with 100% confidence and 39% identity with insect phospholipase A 2 family, which Phyre2 predicted. According to the three-dimensional structure prediction, Maurolipin with five disulfide bonds has a very high similarity to the structure of PLA 2 that belonged to the group III subfamily. The in silico analyses showed that phospholipase A 2 coding gene and protein structure is different based on scorpion species and geographical condition in which they live.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».