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Enregistrement W4300818030 · doi:10.1038/s41398-022-02188-2

Investigating the contributions of circadian pathway and insomnia risk genes to autism and sleep disturbances

2022· article· en· W4300818030 sur OpenAlexafffund
Rackeb Tesfaye, Guillaume Huguet, Zoe Schmilovich, Thomas Renne, Mor Absa Loum, Élise Douard, Zohra Saci, Martineau Jean‐Louis, Jean Luc Martineau, Rob Whelan, Sylvane Desrivières, Andreas Heinz, Günter Schumann, Caroline Hayward, Mayada Elsabbagh, Sébastien Jacquemont

Notice bibliographique

RevueTranslational Psychiatry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChild Nutrition and Feeding Issues
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCentre Azrieli de recherche sur l'autisme, Institut et Hôpital Neurologiques de MontréalMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchChief Scientist Office, Scottish Government Health and Social Care DirectorateScottish GovernmentScottish Funding CouncilWellcome TrustFondation Brain Canada
Mots-clésCircadian rhythmInsomniaAutismSleep (system call)PsychologyPsychiatrySchizophrenia (object-oriented programming)Neuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sleep disturbance is prevalent in youth with Autism Spectrum Disorder (ASD). Researchers have posited that circadian dysfunction may contribute to sleep problems or exacerbate ASD symptomatology. However, there is limited genetic evidence of this. It is also unclear how insomnia risk genes identified through GWAS in general populations are related to ASD and common sleep problems like insomnia traits in ASD. We investigated the contribution of copy number variants (CNVs) encompassing circadian pathway genes and insomnia risk genes to ASD risk as well as sleep disturbances in children with ASD. We studied 5860 ASD probands and 2092 unaffected siblings from the Simons Simplex Collection (SSC) and MSSNG database, as well as 7509 individuals from two unselected populations (IMAGEN and Generation Scotland). Sleep duration and insomnia symptoms were parent reported for SSC probands. We identified 335 and 616 rare CNVs encompassing circadian and insomnia risk genes respectively. Deletions and duplications with circadian genes were overrepresented in ASD probands compared to siblings and unselected controls. For insomnia-risk genes, deletions (not duplications) were associated with ASD in both cohorts. Results remained significant after adjusting for cognitive ability. CNVs containing circadian pathway and insomnia risk genes showed a stronger association with ASD, compared to CNVs containing other genes. Circadian genes did not influence sleep duration or insomnia traits in ASD. Insomnia risk genes intolerant to haploinsufficiency increased risk for insomnia when duplicated. CNVs encompassing circadian and insomnia risk genes increase ASD liability with little to no observable impacts on sleep disturbances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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