Host-encoded, cell surface-associated exopolysaccharide required for adsorption and infection by lactococcal P335 phage subtypes
Notice bibliographique
Résumé
Lactococcus lactis and Lactococcus cremoris compose commercial starter cultures widely used for industrial dairy fermentations. Some lactococcal strains may produce exopolysaccharides (EPS), which have technological applications, including texture production and phage resistance. Two distinct gene clusters associated with EPS production, designated 6073-like and 7127-like, were identified on plasmids in lactococcal strains. Infectivity of two subsets of P335 group phages, distinguished based on their single-component baseplate/receptor-binding protein nucleotide sequences, was correlated to the presence of a host-encoded 6073-like or 7127-like eps gene cluster. Furthermore, phages belonging to these subsets differentially adsorbed to lactococcal strains harboring the respective eps gene cluster. Loss of the respective EPS-encoding plasmid from a fully phage-sensitive strain resulted in loss of phage adsorption and resistance to the phage. Transmission electron microscopy (TEM) showed that the EPS produced by strains encoding the 6073-like or 7127-like eps gene clusters are cell-surface associated, which, coupled with phage plaquing and adsorption data, shows that specific capsular EPS are involved in host recognition by certain P335 phage subgroups. To our knowledge, this is the first description of the involvement of EPS produced via the Wzx/Wzy-dependent pathway in phage sensitivity of L. lactis or L. cremoris. This study also shows strains that do not appear to be phage-related based on plaque formation may still be related by phage adsorption and indicates that optimal formulation of phage-robust cultures should take into account the EPS type of individual strains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».