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Enregistrement W4300863266 · doi:10.1136/bmjmed-2022-000309

Consistency of covid-19 trial preprints with published reports and impact for decision making: retrospective review

2022· article· en· W4300863266 sur OpenAlexafffund
Dena Zeraatkar, Tyler Pitre, Gareth Leung, Ellen Cusano, Arnav Agarwal, Faran Khalid, Zaira Escamilla, Matthew Cooper, Maryam Ghadimi, Ying Wang, Francisca Verdugo‐Paiva, Gabriel Rada, Elena Kum, Anila Qasim, Jessica J Bartoszko, Reed Siemieniuk, Chirag Patel, Gordon Guyatt, Romina Brignardello‐Petersen

Notice bibliographique

RevueBMJ Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueAcademic Publishing and Open Access
Établissements canadiensUniversity of AlbertaImpactUniversity of CalgaryUniversity of OttawaUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineMEDLINEMeta-analysisInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: To assess the trustworthiness (ie, complete and consistent reporting of key methods and results between preprint and published trial reports) and impact (ie, effects of preprints on meta-analytic estimates and the certainty of evidence) of preprint trial reports during the covid-19 pandemic. Design: Retrospective review. Data sources: World Health Organization covid-19 database and the Living Overview of the Evidence (L-OVE) covid-19 platform by the Epistemonikos Foundation (up to 3 August 2021). Main outcome measures: Comparison of characteristics of covid-19 trials with and without preprints, estimates of time to publication of covid-19 preprints, and description of differences in reporting of key methods and results between preprints and their later publications. For the effects of eight treatments on mortality and mechanical ventilation, the study comprised meta-analyses including preprints and excluding preprints at one, three, and six months after the first trial addressing the treatment became available either as a preprint or publication (120 meta-analyses in total, 60 of which included preprints and 60 of which excluded preprints) and assessed the certainty of evidence using the GRADE framework. Results: Of 356 trials included in the study, 101 were only available as preprints, 181 as journal publications, and 74 as preprints first and subsequently published in journals. The median time to publication of preprints was about six months. Key methods and results showed few important differences between trial preprints and their subsequent published reports. Apart from two (3.3%) of 60 comparisons, point estimates were consistent between meta-analyses including preprints versus those excluding preprints as to whether they indicated benefit, no appreciable effect, or harm. For nine (15%) of 60 comparisons, the rating of the certainty of evidence was different when preprints were included versus being excluded-the certainty of evidence including preprints was higher in four comparisons and lower in five comparisons. Conclusion: No compelling evidence indicates that preprints provide results that are inconsistent with published papers. Preprints remain the only source of findings of many trials for several months-an unsuitable length of time in a health emergency that is not conducive to treating patients with timely evidence. The inclusion of preprints could affect the results of meta-analyses and the certainty of evidence. Evidence users should be encouraged to consider data from preprints.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,687
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,928
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,313
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6870,928
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,005
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,017
Bibliométrie0,0210,026
Études des sciences et des technologies0,0030,007
Communication savante0,0150,014
Science ouverte0,0060,008
Intégrité de la recherche0,0060,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,511
Écart entre enseignants0,369 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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