Pacific Salmon: Ecology and Management of Western Alaska’s Populations
Notice bibliographique
Résumé
Abstract.—Microsatellite and major histocompatibility complex (MHC) variation was surveyed to evaluate population structure and the potential for genetic stock identification in chum salmon Oncorhynchus keta populations largely bordering the eastern Bering Sea and northwestern Gulf of Alaska. Variation at 14 microsatellite loci and one MHC locus was surveyed for 59 populations in the study. The genetic differentiation index (Fst) over all populations and loci was 0.023, with individual locus values ranging from 0.007 to 0.058. At least 10 regional stocks were observed in the survey area, with populations from Kotzebue Sound (mean Fst value usually >0.02 in regional comparisons) and the Alaska Peninsula (Fst >0.03) the most distinct of Alaskan populations surveyed. For stock identification applications incorporating DNA variation, chum salmon sampled in rivers’ tributaries to the eastern Bering Sea were classified into the following regions: Kotzebue Sound, Norton Sound, lower/middle Yukon River, Tanana River, Kuskokwim River, Nushagak River, north/central Bristol Bay, southwest Bristol Bay, northern Alaska Peninsula/Aleutian Islands, southwest Alaska Peninsula, and southeast Alaska Peninsula. For simulated single-region mixtures, estimated regional stock compositions were generally above 90% for the previously-listed regions except for the Kuskokwim River, Nushagak and north/central Bristol Bay regions. Incomplete characterization of DNA variation for populations in those regions most likely contributed to the lower accuracies of estimated stock compositions in the simulated mixtures. Estimated regional stock compositions of simulated samples comprising fish from several regions were within 1–3% of actual values provided that no contributions from the three under-represented regions were included in the simulated samples. Microsatellite and MHC variation has the potential to provide accurate estimates of regional stock composition for chum salmon fisheries in the Bering Sea and northern Gulf of Alaska.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».