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Enregistrement W4301393953 · doi:10.3389/fmolb.2022.990861

Noncovalent hyaluronan crosslinking by TSG-6: Modulation by heparin, heparan sulfate, and PRG4

2022· article· en· W4301393953 sur OpenAlexfundno aff
Yun Jin Ashley Sin, Rebecca MacLeod, Adam P. Tanguay, Andrew Wang, Olivia Braender-Carr, Teraesa M. Vitelli, Gregory D. Jay, Tannin A. Schmidt, Mary K. Cowman

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversity of Connecticut Health CenterYork UniversityInes Mandl Research FoundationNew York University
Mots-clésSulfationChemistryDisaccharideGlycosaminoglycanHeparan sulfateChondroitin sulfateHeparinBiophysicsBiochemistryProteoglycanStereochemistryExtracellular matrixBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The size, conformation, and organization of the glycosaminoglycan hyaluronan (HA) affect its interactions with soluble and cell surface-bound proteins. HA that is induced to form stable networks has unique biological properties relative to unmodified soluble HA. AlphaLISA assay technology offers a facile and general experimental approach to assay protein-mediated networking of HA in solution. Connections formed between two end-biotinylated 50 kDa HA (bHA) chains can be detected by signal arising from streptavidin-coated donor and acceptor beads being brought into close proximity when the bHA chains are bridged by proteins. We observed that incubation of bHA with the protein TSG-6 (tumor necrosis factor alpha stimulated gene/protein 6, TNFAIP/TSG-6) leads to dimerization or higher order multimerization of HA chains in solution. We compared two different heparin (HP) samples and two heparan sulfate (HS) samples for the ability to disrupt HA crosslinking by TSG-6. Both HP samples had approximately three sulfates per disaccharide, and both were effective in inhibiting HA crosslinking by TSG-6. HS with a relatively high degree of sulfation (1.75 per disaccharide) also inhibited TSG-6 mediated HA networking, while HS with a lower degree of sulfation (0.75 per disaccharide) was less effective. We further identified Proteoglycan 4 (PRG4, lubricin) as a TSG-6 ligand, and found it to inhibit TSG-6-mediated HA crosslinking. The effects of HP, HS, and PRG4 on HA crosslinking by TSG-6 were shown to be due to HP/HS/PRG4 inhibition of HA binding to the Link domain of TSG-6. Using the AlphaLISA platform, we also tested other HA-binding proteins for ability to create HA networks. The G1 domain of versican (VG1) effectively networked bHA in solution but required a higher concentration than TSG-6. Cartilage link protein (HAPLN1) and the HA binding protein segment of aggrecan (HABP, G1-IGD-G2) showed only low and variable magnitude HA networking effects. This study unambiguously demonstrates HA crosslinking in solution by TSG-6 and VG1 proteins, and establishes PRG4, HP and highly sulfated HS as modulators of TSG-6 mediated HA crosslinking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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