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Enregistrement W4302023680 · doi:10.21203/rs.3.rs-2100869/v1

MiPy: A Framework for Benchmarking Machine Learning Prediction of Unplanned Hospital and ICU Readmission in the MIMIC-IV Database

2022· preprint· en· W4302023680 sur OpenAlexaff
Andi Partovi, Dickson Lukose, Geoffrey I. Webb

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHeart Failure Treatment and Management
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesMonash University
Mots-clésComparabilityBenchmarkingComputer scienceHealth careResource (disambiguation)Predictive modellingConfidentialityField (mathematics)Quality (philosophy)DatabaseMedicineMachine learningArtificial intelligenceBusinessComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Avoidable and unplanned readmissions to hospital wards, especially the Intensive Care Unit, have significant implications for the patients’ health and poses additional economic burdens on the health system. If patients who are at risk of readmission are identified early and their risks are mitigated, these complications can be avoided. Machine Learning has been a valuable tool for automatic identification and prediction of various health conditions and situations, including unplanned readmissions. This is made possible through processing large collections of clinical data to build predictive models. However, the clinical data from which these models are built is highly confidential, which has restricted the ability of researchers to provide their data to the wider community, hence limiting reproducibility and comparability between results. The MIMIC databases are large, publicly available clinical datasets, which make reproducibility and comparability feasible. To maximise the benefit the research community derives from this invaluable resource, we developed MiPy, an open source standardised framework for preparing, building, and evaluating machine learning models for predicting both hospital and ICU readmission, on the MIMIC-IV database. The primary aim of this work is to enhance reproducibility and comparability of research in the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,059
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,059
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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