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Enregistrement W4302065839 · doi:10.48550/arxiv.1803.05377

When few survive to tell the tale: thymus and gonad as auditioning\n organs: historical overview

2018· preprint· W4302065839 sur OpenAlexaff
Donald R. Forsdyke

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2018
Typepreprint
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal Hormones and Disorders
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGameteGametogenesisGeneGeneticsFunction (biology)Cell biologyImmune systemSpermEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unlike other organs, the thymus and gonads generate non-uniform cell\npopulations, many members of which perish, and a few survive. While it is\nrecognized that thymic cells are 'audited' to optimize an organism's immune\nrepertoire, whether gametogenesis could be orchestrated similarly to favour\nhigh quality gametes is uncertain. Ideally, such quality would be affirmed at\nearly stages before the commitment of extensive parental resources. A case is\nhere made that, along the lines of a previously proposed lymphocyte quality\ncontrol mechanism, gamete quality can be registered indirectly through\ndetection of incompatibilities between proteins encoded by the grandparental\nDNA sequences within the parent from which haploid gametes are meiotically\nderived. This 'stress test' is achieved in the same way that thymic screening\nfor potential immunological incompatibilities is achieved - by 'promiscuous'\nexpression, under the influence of the AIRE protein, of the products of genes\nthat are not normally specific for that organ. Consistent with this, the Aire\ngene is expressed in both thymus and gonads, and AIRE deficiency impedes\nfunction in both organs. While not excluding the subsequent emergence of hybrid\nincompatibilities due to the intermixing of genomic sequences from parents\n(rather than grandparents), many observations, such as the number of proteins\nthat are aberrantly expressed during gametogenesis, can be explained on this\nbasis. Indeed, promiscuous expression could have first evolved in\ngamete-forming cells where incompatible proteins would be manifest as aberrant\nprotein aggregates that cause apoptosis. This mechanism would later have been\nco-opted by thymic epithelial cells which display peptides from aggregates to\nremove potentially autoreactive T cells.\n

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,285
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,135 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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