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Enregistrement W4302292895 · doi:10.26434/chemrxiv-2022-m719x

Fast Evaluation of the Adsorption Energy ofOrganic Molecules on Metals via GraphNeural Networks

2022· preprint· en· W4302292895 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónMinisterio de Ciencia e Innovación
Mots-clésAdsorptionMoleculeDensity functional theoryArtificial neural networkHeteroatomAtom (system on chip)Materials scienceComputational chemistryChemistryComputer sciencePhysical chemistryOrganic chemistryMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modeling of solid-state material-molecule interfaces in heterogeneous catalysis requires the extensive evaluation of the energy of molecules on surfaces. Obtaining the binding energy of many configurations of large organic molecules requires a vast amount of computational time with density functional theory (DFT). Here, we use a graph neural network (GNN) to evaluate the adsorption energy of molecular species adsorbed on metallic surfaces. The GNN is trained on a set of C1–4 fragments including N, O, S heteroatoms and C6–10 aromatic rings. Compared to DFT, the GNN shows a mean absolute error (MAE) of 0.17 eV on the test set being 6 orders of magnitude faster. When applying the trained model with subsequent hyperparameter optimization to molecules of industrial interest (biomass, plastics and polyurethanes precursors) containing up to 22 carbon atoms, the prediction performance for the adsorption energy yields a MAE of 0.03 eV/(non-H atom). While the error for out-of-distribution molecules is higher, it is still within the acceptable limit for adsorption energies (0.05 eV/atom), confirming the viability of the approach. The proposed framework represents a potential tool for the fast screening of catalytic materials, as well as their inverse design, enabling the multi-scale modeling for systems that cannot be easily simulated by DFT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,115
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle