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Enregistrement W4302307258 · doi:10.1183/13993003.01796-2022

Reply to: Broadening concepts of core pathobiology in various aspects of COPD development

2022· letter· en· W4302307258 sur OpenAlexaff
Feng Xu, Dragoş M. Vasilescu, Wan C. Tan, Jim Hogg, Tillie‐Louise Hackett

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2022
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia HospitalSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCOPDBronchioleAirwayPathologyLungMedicineLung cancerDiseaseStage (stratigraphy)Pulmonary diseaseBiologyInternal medicineSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We thank E.H. Walters and co-workers for highlighting the innovation of our study [1] using micro-computed tomography (micro-CT) imaging to match tissue pathology with its gene transcriptome, in order to understand the pathobiology of small airway disease in end-stage COPD. We agree with the authors that post-transplant, explanted COPD lungs do represent the end stages of the disease; however, such lung samples provide the only opportunity to assess the entire lung structure and the heterogeneity of small airway disease and emphysema across lung height without the presence of cancer. As the authors note, we have previously shown that destruction of the last generation of small conducting airways, the terminal bronchioles, precedes emphysematous tissue destruction in end-stage COPD [2]. More recently, this work has been validated using formalin-fixed-paraffin embedded (FFPE) samples from patients with mild and moderate COPD, which demonstrated over 41% of their terminal bronchioles are destroyed prior to the detection of emphysema on clinical CT or microscopically on micro-CT [3]. These data highlight that loss of terminal bronchioles occurs early in the disease process and understanding the pathobiology of terminal bronchiole reduction has the potential to develop new therapeutics for COPD. Understanding the pathology of COPD by assessing the “hot spots” or earliest regions of small airway disease

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,040
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,040
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0030,009
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0240,054
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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