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Enregistrement W4302425337 · doi:10.1126/science.abj2890

A noncoding single-nucleotide polymorphism at 8q24 drives <i>IDH1</i> -mutant glioma formation

2022· article· en· W4302425337 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkHospital for Sick ChildrenLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesCenter for Individualized Medicine, Mayo ClinicNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKGovernment of OntarioNational Human Genome Research InstituteUniversity of California, San FranciscoU.S. Department of Energy
Mots-clésPenetranceIsocitrate dehydrogenaseIDH1Locus (genetics)BiologySingle-nucleotide polymorphismGliomaAlleleMutantGeneticsEnhancerNucleotideGeneCancer researchPhenotypeTranscription factorGenotypeEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Establishing causal links between inherited polymorphisms and cancer risk is challenging. Here, we focus on the single-nucleotide polymorphism rs55705857, which confers a sixfold greater risk of isocitrate dehydrogenase ( IDH) –mutant low-grade glioma (LGG). We reveal that rs55705857 itself is the causal variant and is associated with molecular pathways that drive LGG. Mechanistically, we show that rs55705857 resides within a brain-specific enhancer, where the risk allele disrupts OCT2/4 binding, allowing increased interaction with the Myc promoter and increased Myc expression. Mutating the orthologous mouse rs55705857 locus accelerated tumor development in an Idh1 R132H -driven LGG mouse model from 472 to 172 days and increased penetrance from 30% to 75%. Our work reveals mechanisms of the heritable predisposition to lethal glioma in ~40% of LGG patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle