Genotyping and Cytology Triage of High-Risk HPV DNA Positive Women for Detection of Cervical High-Grade Lesions
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: A demonstration project of primary human papillomavirus (HPV) testing was initiated in 2011 among more than 23,000 women attending routine cervical cancer screening. We examined the additional diagnostic performance of HPV genotyping for detecting disease in women with abnormal cytology. METHODS: Women aged 30 to 65 years were originally screened for HPV using Hybrid Capture II test. Women with positive results were triaged using conventional cytology, and those with atypical squamous cells of undetermined significance or worse (≥ASC-US) were referred to colposcopy. We retrospectively genotyped (Roche cobas 4800 HPV system [Roche Molecular Systems Inc, Pleasanton, CA]) cervical specimens that were HPV + with Hybrid Capture II test and extracted women's medical history postbaseline screening. We calculated positive predictive values (PPVs) and 95% confidence intervals (CIs) of triage tests to detect histologically confirmed cervical intraepithelial neoplasia of grade 2 or worse (CIN2 + ) within the first year of follow-up among women positive for HPV16, HPV18, and HPV16 and/or HPV18 as well as among those negative for HPVs 16 and 18. RESULTS: Of 1,396 HPV-positive women, 1,092 (78%) were classified as normal, 136 (10%) had CIN1, 80 (6%) had CIN2, 81 (6%) had CIN3, and 7 women had cancer throughout the entire follow-up period. Seventy CIN2 + cases were detected within the first year of follow-up. The PPV for detecting CIN2 + was 20.9% (63/239; 95% CI = 16.4-25.9) for ASC-US + cytology. In women with ASC-US + , PPVs were 31.2% (24/77; 95% CI = 21.1-42.7) for HPV16 + , 27.8% (5/18; 95% CI = 9.7-53.5) for HPV18 + , 30.8% (28/91; 95% CI = 21.5-41.3) for HPV16 + and/or HPV18 + women, and 16.6% (35/211; 95% CI = 11.8-22.3) in women testing negative for HPVs 16 and 18. CONCLUSION: Partial genotyping as an additional triage strategy to cytology can markedly improve clinical diagnostic performance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».