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Enregistrement W4303473137 · doi:10.1016/s1473-3099(22)00651-x

Epidemiological and clinical characteristics of patients with monkeypox in the GeoSentinel Network: a cross-sectional study

2022· article· en· W4303473137 sur OpenAlexaff
Kristina M Angelo, Teresa Smith, Daniel Camprubí, Leire Balerdi-Sarasola, Marta Díaz‐Menéndez, Guillermo Servera-Negre, Sapha Barkati, Alexandre Duvignaud, Kristina L B Huber, Arpita Chakravarti, Emmanuel Bottieau, Christina Greenaway, Martin P. Grobusch, Diogo Mendes Pedro, Hilmir Ásgeirsson, Corneliu Petru Popescu, Charlotte Martin, Carmelo Licitra, Albie de Frey, Eli Schwartz, Michael Beadsworth, Susana Lloveras, Carsten Schade Larsen, Sarah Anne J. Guagliardo, Florence Whitehill, Ralph Huits, Davidson H. Hamer, Phyllis E. Kozarsky, Michael Libman, Lucille Blumberg, H. Chaussade, Arnaud Desclaux, Éric Florence, Simin Aysel Florescu, Hedvig Glans, Marielle Glynn, Abraham Goorhuis, Marina B. Klein, Denis Malvy, Andrea M. McCollum, José Muñóz, Duc T. Nguyen, Laura A.S. Quilter, Camilla Rothe, Patrick Soentjens, Camille Tumiotto, Jef Vanhamel

Notice bibliographique

RevueThe Lancet Infectious Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePoxvirus research and outbreaks
Établissements canadiensInstitute of Infection and ImmunityJewish General HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionInternational Society of Travel Medicine
Mots-clésMonkeypoxCross-sectional studyEpidemiologyMedicineEnvironmental healthPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background The early epidemiology of the 2022 monkeypox epidemic in non-endemic countries differs substantially from the epidemiology previously reported from endemic countries. We aimed to describe the epidemiological and clinical characteristics among individuals with confirmed cases of monkeypox infection. Methods We descriptively analysed data for patients with confirmed monkeypox who were included in the GeoSentinel global clinical-care-based surveillance system between May 1 and July 1 2022, across 71 clinical sites in 29 countries. Data collected included demographics, travel history including mass gathering attendance, smallpox vaccination history, social history, sexual history, monkeypox exposure history, medical history, clinical presentation, physical examination, testing results, treatment, and outcomes. We did descriptive analyses of epidemiology and subanalyses of patients with and without HIV, patients with CD4 counts of less than 500 cells per mm 3 or 500 cells per mm 3 and higher, patients with one sexual partner or ten or more sexual partners, and patients with or without a previous smallpox vaccination. Findings 226 cases were reported at 18 sites in 15 countries. Of 211 men for whom data were available, 208 (99%) were gay, bisexual, or men who have sex with men (MSM) with a median age of 37 years (range 18–68; IQR 32–43). Of 209 patients for whom HIV status was known, 92 (44%) men had HIV infection with a median CD4 count of 713 cells per mm 3 (range 36–1659; IQR 500–885). Of 219 patients for whom data were available, 216 (99%) reported sexual or close intimate contact in the 21 days before symptom onset; MSM reported a median of three partners (IQR 1–8). Of 195 patients for whom data were available, 78 (40%) reported close contact with someone who had confirmed monkeypox. Overall, 30 (13%) of 226 patients were admitted to hospital; 16 (53%) of whom had severe illness, defined as hospital admission for clinical care rather than infection control. No deaths were reported. Compared with patients without HIV, patients with HIV were more likely to have diarrhoea (p=0·002), perianal rash or lesions (p=0·03), and a higher rash burden (median rash burden score 9 [IQR 6–21] for patients with HIV vs median rash burden score 6 [IQR 3–14] for patients without HIV; p<0·0001), but no differences were identified in the proportion of men who had severe illness by HIV status. Interpretation Clinical manifestations of monkeypox infection differed by HIV status. Recommendations should be expanded to include pre-exposure monkeypox vaccination of groups at high risk of infection who plan to engage in sexual or close intimate contact. Funding US Centers for Disease Control and Prevention, International Society of Travel Medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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