SERPINE1 DNA Methylation Levels Quantified in Blood Cells at Five Years of Age Are Associated with Adiposity and Plasma PAI-1 Levels at Five Years of Age
Notice bibliographique
Résumé
Plasminogen activator inhibitor (PAI-1) expression has been associated with a higher risk of development of obesity. DNA methylation (DNAm) is an epigenetic mechanism regulating gene transcription and likely involved in the fetal programming of childhood obesity. Our study aimed to assess the associations between PAI-1 gene (SERPINE1) DNAm, plasma PAI-1 levels, and adiposity at five years of age. We analyzed DNAm and anthropometric data from 146 girls and 177 boys from the Gen3G prospective birth cohort. We assessed adiposity using BMI z-scores, waist circumference, total skinfolds, and percentages of total, android, and trunk fat measured by dual-energy radiography (DXA). We estimated blood cell DNAm levels at 15 CpG sites within SERPINE1 using the methylationEPIC array. After correction for multiple testing, we found that lower DNAm in SERPINE1 intron 3 (cg11353706) was associated with greater adiposity levels in girls (waist circumference: r = −0.258, p = 0.002; skinfolds: r = −0.212, p = 0. 013; android fat: r = −0.215, p = 0.015; BMI z-score: r = −0.278, p < 0.001) and that lower DNAm in the SERPINE1 promoter (cg19722814) was associated with higher plasma PAI-1 levels in boys (r = −0.178, p = 0.021). Our study suggests that DNAm levels at the SERPINE1 gene locus are negatively correlated with adiposity, but not with plasma PAI-1 levels, in young girls only.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».