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Enregistrement W4303858606 · doi:10.1186/s13223-022-00729-4

Development and initial validation of a modified lymphocyte transformation test (LTT) assay in patients with DRESS and AGEP

2022· article· en· W4303858606 sur OpenAlexvenueno aff
Chris Weir, Jamma Li, Richard Fulton, Suran L. Fernando

Notice bibliographique

RevueAllergy Asthma and Clinical Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug-Induced Adverse Reactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransformation (genetics)Test (biology)Reliability engineeringPsychologyMedicineImmunologyChemistryGeologyEngineeringBiochemistryPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The lymphocyte transformation test (LTT) is an in vitro assay used to diagnose drug induced hypersensitivity reactions by detecting the activation and expansion of drug-specific memory T cells to the suspected implicated drug. Traditionally radiolabelled thymidine (3H-thymidine) has been used but requires the handling and disposal of radioactive materials. OBJECTIVE: To examine safe alternatives to 3H-thymidine, test assay modifications for improved assay sensitivity and evaluate the modified LTT in patients with DRESS and AGEP. METHODS: Four proliferation detection assays (BRDU, CyQUANT™, MTT and XTT) were screened for LTT sensitivity. XTT the most sensitive and practical was selected for further evaluation Modifications like autologous serum (AS) and regulatory T cell depletion (T-REG) were tested for improved assay sensitivity. Finally, an initial evaluation of the XTT-LTT was performed in 8 patients with DRESS and 2 with AGEP including cytokine testing. RESULTS: Of the non-radioactive alternatives we tested, XTT a colorimetric assay was the most sensitive and practical to move to evaluation. The addition of AS increased background signal. Depletion of T-REGs improved sensitivity but cell sorting time and risk of contamination limited benefit. Of eight patients diagnosed with DRESS and 2 with AGEP tested with XTT-LTT assay results showed our assay matched clinical findings of implicated drugs in 8/10 patients when using a stimulation index (SI) ≥ 2 and 8/10 with analysis by ANOVA. All ten patients were correctly diagnosed by either analysis. CONCLUSION: XTT appears to be a safe, viable alternative to 3H-thymidine, with high sensitivity and allowing direct cytokine quantification on specific patient cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,929
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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