Infection with a Recently Discovered Gammaherpesvirus Variant in European Badgers, Meles meles, is Associated with Higher Relative Viral Loads in Blood
Notice bibliographique
Résumé
Herpesviruses are ubiquitous pathogens infecting most animals. Although host immunity continually coevolves to combat virulence, viral variants with enhanced transmissibility or virulence occasionally emerge, resulting in disease burdens in host populations. Mustelid gammaherpesvirus 1 (MusGHV-1) is the only herpesvirus species identified thus far in European badgers, Meles meles. No MusGHV-1 associated pathomorbidity has been reported, but reactivation of MusGHV-1 in genital tracts is linked to impaired female reproductive success. An analysis of a short sequence from the highly conserved DNA polymerase (DNApol) gene previously identified two variants in a single host population. Here we compared genetic variance in blood samples from 66 known individuals of this same free-ranging badger population using a partial sequence comprising 2874 nucleotides of the DNApol gene, among which we identified 15 nucleotide differences resulting in 5 amino acid differences. Prevalence was 86% (59/66) for the common and 17% (11/66) for the novel variant, with 6% (4/66) of badgers presenting with coinfection. MusGHV-1 variants were distributed unevenly across the population, with individuals infected with the novel genotype clustered in 3 of 25 contiguous social groups. Individuals infected with the novel variant had significantly higher MusGHV-1 viral loads in their blood (p = 0.002) after adjusting for age (juveniles > adults, p < 0.001) and season (summer > spring and autumn, p = 0.005; mixed-effect linear regression), likely indicating higher virulence of the novel variant. Further genome-wide analyses of MusGHV-1 host resistance genes and host phenotypic variations are required to clarify the drivers and sequelae of this new MusGHV-1 variant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».