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Enregistrement W4304080786 · doi:10.1111/ejn.15839

Towards a machine‐learning assisted diagnosis of psychiatric disorders and their operationalization in preclinical research: Evidence from studies on addiction‐like behaviour in individual rats

2022· article· en· W4304080786 sur OpenAlexfundno aff
Kshitij Jadhav, Benjamin Boury Jamot, Véronique Deroche‐Gamonet, David Belin, Benjamin Boutrel

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversité de BordeauxMedical Research Council CanadaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCentre Hospitalier Universitaire VaudoisSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungAgence Nationale de la RechercheNational Science Foundation
Mots-clésOperationalizationAddictionPsychologyPreclinical researchPsychiatryNeuroscienceClinical psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the last few decades, there has been a progressive transition from a categorical to a dimensional approach to psychiatric disorders. Especially in the case of substance use disorders, interest in the individual vulnerability to transition from controlled to compulsive drug taking warrants the development of novel dimension-based objective stratification tools. Here we drew on a multidimensional preclinical model of addiction, namely the 3-criteria model, previously developed to identify the neurobehavioural basis of the individual's vulnerability to switch from controlled to compulsive drug taking, to test a machine-learning assisted classifier objectively to identify individual subjects as vulnerable/resistant to addiction. Datasets from our previous studies on addiction-like behaviour for cocaine or alcohol were fed into a variety of machine-learning algorithms to develop a classifier that identifies resilient and vulnerable rats with high precision and reproducibility irrespective of the cohort to which they belong. A classifier based on K-median or K-mean-clustering (for cocaine or alcohol, respectively) followed by artificial neural networks emerged as a highly reliable and accurate tool to predict if a single rat is vulnerable/resilient to addiction. Thus, each rat previously characterized as displaying 0-criterion (i.e., resilient) or 3-criteria (i.e., vulnerable) in individual cohorts was correctly labelled by this classifier. The present machine-learning-based classifier objectively labels single individuals as resilient or vulnerable to developing addiction-like behaviour in a multisymptomatic preclinical model of addiction-like behaviour in rats. This novel dimension-based classifier increases the heuristic value of these preclinical models while providing proof of principle to deploy similar tools for the future of diagnosis of psychiatric disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,261
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,155 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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