The spatial transcriptomic landscape of non-small cell lung cancer brain metastasis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Brain metastases (BrMs) are a common occurrence in lung cancer with a dismal outcome. To understand the mechanism of metastasis to inform prognosis and treatment, here we analyze primary and metastasized tumor specimens from 44 non-small cell lung cancer patients by spatial RNA sequencing, affording a whole transcriptome map of metastasis resolved with morphological markers for the tumor core, tumor immune microenvironment (TIME), and tumor brain microenvironment (TBME). Our data indicate that the tumor microenvironment (TME) in the brain, including the TIME and TBME, undergoes extensive remodeling to create an immunosuppressive and fibrogenic niche for the BrMs. Specifically, the brain TME is characterized with reduced antigen presentation and B/T cell function, increased neutrophils and M2-type macrophages, immature microglia, and reactive astrocytes. Differential gene expression and network analysis identify fibrosis and immune regulation as the major functional modules disrupted in both the lung and brain TME. Besides providing systems-level insights into the mechanism of lung cancer brain metastasis, our study uncovers potential prognostic biomarkers and suggests that therapeutic strategies should be tailored to the immune and fibrosis status of the BrMs.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle