Identification and differential usage of a host metalloproteinase entry pathway by SARS-CoV-2 Delta and Omicron
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) spike glycoprotein (S) binds to angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) to mediate membrane fusion via two distinct pathways: 1) a surface, serine protease-dependent or 2) an endosomal, cysteine protease-dependent pathway. In this study, we found that SARS-CoV-2 S has a wider protease usage and can also be activated by TMPRSS13 and matrix metalloproteinases (MMPs). We found that MMP-2 and MMP-9 played roles in SARS-CoV-2 S cell-cell fusion and TMPRSS2- and cathepsin-independent viral entry in cells expressing high MMP levels. MMP-dependent viral entry required cleavage at the S1/S2 junction in viral producer cells, and differential processing of variants of concern S dictated its usage; the efficiently processed Delta S preferred metalloproteinase-dependent entry when available, and less processed Omicron S was unable to us metalloproteinases for entry. As MMP-2/9 are released during inflammation, they may play roles in S-mediated cytopathic effects, tropism, and disease outcome.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle