Genome-wide identification and expression analysis of the polyamine oxidase gene family in soybean
Notice bibliographique
Résumé
Polyamine oxidases (PAOs) are flavin adenine dinucleotide-dependent enzymes that are involved in polyamine catabolism and play an essential role in growth and developmental processes as well as the response to abiotic stresses. Although the PAO gene families have been intensively studied in many plants, the soybean ( Glycine max (L.) Merr.) PAO gene family has not been systematically identified. Here, we identified six PAO genes in the soybean genome and named them GmPAO1– GmPAO6. The phylogenetic analysis revealed that plant PAO proteins are divided into four classes. GmPAO1 and GmPAO4 belong to class I; GmPAO2, GmPAO5, and GmPAO6 belong to class IV. Similar to most dicotyledonous plants, soybeans do not contain class II. Interestingly, we identified an additional SWIRM-domain PAO gene GmPAO3, which exists between classes III and IV . GmPAO3 had a different gene structure and expression. To determine the individual roles of GmPAOs, we analyzed their expression levels in various tissues and under abiotic stress. Each GmPAO gene can respond in a specific tissue under specific abiotic stress. The data can help to clarify the role of GmPAOs in abiotic stress responses in soybean and provide a breeding basis for enhancing soybean tolerance to abiotic stresses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».