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Enregistrement W4304203412 · doi:10.1002/2211-5463.13497

Molecular characterization of accripin11, a soluble shell protein with an acidic C‐terminus, identified in the prismatic layer of the Mediterranean fan mussel <i>Pinna nobilis</i> (Bivalvia, Pteriomorphia)

2022· article· en· W4304203412 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFEBS Open Bio · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueCalcium Carbonate Crystallization and Inhibition
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheConseil régional de Bourgogne-Franche-ComtéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Marine Biological Resource Centre BelgiumUniversité de BourgogneMax-Planck-GesellschaftDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyComplementary DNAPeptide sequenceMusselBiomineralizationBivalviaShell (structure)Amino acidPolyclonal antibodiesBiochemistryMolluscaGeneGeneticsPaleontologyAntibodyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have identified a novel shell protein, accripin11, as a major soluble component of the calcitic prisms of the fan mussel Pinna nobilis . Initially retrieved from a cDNA library, its full sequence is confirmed here by transcriptomic and proteomic approaches. The sequence of the mature protein is 103 residues with a theoretical molecular weight of 11 kDa and is moderately acidic (pI 6.74) except for its C‐terminus which is highly enriched in aspartic acid. The protein exhibits a peculiar cysteine pattern in its central domain. The full sequence shares similarity with six other uncharacterized molluscan shell proteins from the orders Ostreida, Pteriida and Mytilida, all of which are pteriomorphids and produce a phylogenetically restricted pattern of nacro‐prismatic shell microstructures. This suggests that accripin11 is a member of a family of clade‐specific shell proteins. A 3D model of accripin11 was predicted with AlphaFold2, indicating that it possesses three short alpha helices and a disordered C‐terminus. Recombinant accripin11 was tested in vitro for its ability to influence the crystallization of CaCO 3 , while a polyclonal antibody was able to locate accripin11 to prismatic extracts, particularly in the acetic acid‐soluble matrix. The putative functions of accripin11 are further discussed in relation to shell biomineralization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle