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Enregistrement W4304588935 · doi:10.1101/2022.10.10.511668

A CREBZF/Zhangfei isoform activates CHOP during prolonged cellular stress

2022· preprint· en· W4304588935 sur OpenAlexaff
Yu Li, Wan Kong Yip, Jenna Penney, Tiegh Taylor, Yani Zhang, Minghua Zeng, Timothy E. Audas, Ray Lu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformCHOPUnfolded protein responseTranscription factorCell biologyCellular stress responseTranscription (linguistics)RNA splicingBiologyAlternative splicingCcaat-enhancer-binding proteinsATF4Activator (genetics)Leucine zipperActivating transcription factorMolecular biologyDNA-binding proteinRNAGeneEndoplasmic reticulumFight-or-flight responseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The basic leucine zipper transcription factor CREBZF (Zhangfei or ZF) was identified through its interaction with Herpes Simplex Virus-1 related cellular protein HCF-1. CREBZF has been implicated in cellular stress responses through its interaction with other proteins, such as CREB3/Luman and ATF4. Here we investigated the production of four CREBZF isoforms, which arise from translational initiation of a downstream AUG at codon 83, and mRNA alternative splicing that adds an IFFFR pentapeptidyl tail to the C-terminus. We found that in addition to transcriptional activation, the short-tailed CREBZF (stZF) isoform was specifically induced by prolonged ER stress treatment. This stZF isoform is a potent transcriptional activator of the pro-apoptotic protein CHOP. Overexpression of stZF activates transcription of CHOP through a CCAAT enhancer binding protein (C/EBP)-ATF site, and promotes apoptosis. We propose that 1) CREBZF is a key component of the Integrated Stress Response (ISR); 2) stZF is essential for the role of CREBZF in inducing CHOP and promoting cell death upon prolonged cellular stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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