MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4304606597 · doi:10.1101/2022.10.10.511562

Simultaneous widefield voltage and interferometric dye-free optical mapping quantifies electromechanical waves in human iPSC-cardiomyocytes

2022· preprint· en· W4304606597 sur OpenAlexaff
Wei Liu, Julie Han, Jakub Tomek, Gil Bub, Emilia Entcheva

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesDivision of Emerging Frontiers in Research and InnovationNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésOptical mappingVoltage-sensitive dyeInduced pluripotent stem cellInterferometryMaterials scienceOptoelectronicsOpticsBiomedical engineeringPhysicsChemistryOptical imagingMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Coupled electro-mechanical waves define heart’s function in health and disease. Genetic abnormalities, drug-triggered or acquired pathologies can disrupt and uncouple these waves with potentially lethal consequences. Optical mapping of electrical waves using fluorescent dyes or genetically-encoded sensors in human induced pluripotent stem cell derived cardiomyocytes (iPSC-CMs) offers mechanistic insights into cardiac conduction abnormalities. Interferometric dye-free/label-free wave mapping (without specific sensors) presents an alternative, likely capturing the mechanical aspects of cardiac conduction. Because of its non-invasive nature and spectral flexibility (not restricted to a specific excitation wavelength), it is an attractive chronic imaging tool in iPSC-CMs, as part of all-optical high-throughput platforms. In this study, we developed simultaneous widefield voltage and interferometric dye-free optical imaging methodology that was used: 1) to validate dye-free optical mapping for quantification of cardiac wave properties in human iPSC-CMs; 2) to demonstrate low-cost optical mapping of electromechanical waves in hiPSC-CMs using recent near-infrared (NIR) voltage sensors and orders of magnitude cheaper miniature CMOS cameras; 3) to uncover previously underexplored frequency- and space-varying parameters of cardiac electromechanical waves in hiPSC-CMs. We find similarity in the frequency-dependent responses of electrical (NIR fluorescence imaged) and mechanical (dye-free imaged) waves, with the latter being more sensitive to faster rates and showing steeper restitution and earlier appearance of wave-front tortuosity. During regular pacing, the dye-free imaged conduction velocity and the electrical wave velocity are correlated; both modalities being sensitive to pharmacological uncoupling and both dependent on gap-junctional protein (connexins) determinants of wave propagation. We uncover strong frequency-dependence of the electromechanical delay (EMD) locally and globally in hiPSC-CMs on a rigid substrate. The presented framework and results offer new means to track the functional responses of hiPSC-CM inexpensively and non-invasively for counteracting heart disease and aiding cardiotoxicity testing and drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetCardiac electrophysiology and arrhythmias→Travaux en français237 207→