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Enregistrement W4304630449 · doi:10.1002/1878-0261.13322

Heterogeneous <scp>RNA</scp> editing and influence of <scp>ADAR2</scp> on mesothelioma chemoresistance and the tumor microenvironment

2022· article· en· W4304630449 sur OpenAlexaff
Ananya Hariharan, Weihong Qi, Hubert Rehrauer, Licun Wu, Manuel Ronner, Martin Wipplinger, Jelena Kresoja‐Rakic, Suna Sun, Lucia Oton‐Gonzalez, Marika Sculco, Véronique Serre‐Beinier, Clément Meiller, Christophe Blanquart, Jean‐François Fonteneau, Bart Vrugt, Jan H. Rüschoff, Isabelle Opitz, Didier Jean, Marc de Perrot, Emanuela Felley‐Bosco

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesChancellerie des Universités de ParisCancéropôle Ile de FranceChina Scholarship CouncilLigue Contre le CancerConseil Régional, Île-de-FranceNational Outstanding Youth Science Fund Project of National Natural Science Foundation of ChinaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésADARRNA editingBiologyRNACancer researchTumor microenvironmentMesotheliomamicroRNAGene knockdownDownregulation and upregulationCell growthCell cultureMedicinePathologyGeneticsGeneTumor cells

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously observed increased levels of adenosine-deaminase-acting-on-dsRNA (Adar)-dependent RNA editing during mesothelioma development in mice exposed to asbestos. The aim of this study was to characterize and assess the role of ADAR-dependent RNA editing in mesothelioma. We found that tumors and mesothelioma primary cultures have higher ADAR-mediated RNA editing compared to mesothelial cells. Unsupervised clustering of editing in different genomic regions revealed heterogeneity between tumor samples as well as mesothelioma primary cultures. ADAR2 expression levels are higher in BRCA1-associated protein 1 wild-type tumors, with corresponding changes in RNA editing in transcripts and 3'UTR. ADAR2 knockdown and rescue models indicated a role in cell proliferation, altered cell cycle, increased sensitivity to antifolate treatment, and type-1 interferon signaling upregulation, leading to changes in the microenvironment in vivo. Our data indicate that RNA editing contributes to mesothelioma heterogeneity and highlights an important role of ADAR2 not only in growth regulation in mesothelioma but also in chemotherapy response, in addition to regulating inflammatory response downstream of sensing nucleic acid structures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,169
Score d'incertitude au seuil0,693

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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