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Enregistrement W4304762422 · doi:10.3390/epigenomes6040035

Scatter Irradiation of Rat Brain Triggers Sex- and Brain Region-Specific Changes in the Expression of Non-Coding RNA Fragments

2022· article· en· W4304762422 sur OpenAlexafffund
Anna Fiselier, Boseon Byeon, Yaroslav Ilnytskyy, Olga Kovalchuk, Igor Kovalchuk

Notice bibliographique

RevueEpigenomes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of LethbridgeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNon-coding RNARNABiologymicroRNAGene expressionGeneLong non-coding RNATransfer RNANeuroscienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-coding RNA fragments (ncRFs) are small RNA fragments processed from non-coding RNAs (ncRNAs). ncRFs have various functions and are commonly tissue-specific, and their processing is altered by exposure to stress. Information about ncRFs in the brain is scarce. Recently, we reported the brain region-specific and sex-specific expression of ncRNAs and their processing into ncRFs. Here, we analyzed the expression of ncRFs in the frontal cortex (FC), hippocampus (HIP), and cerebellum (CER) of male and female rats exposed to scatter radiation. We found multiple brain region- and sex-specific changes in response to scatter radiation. Specifically, we observed decreased miRNA expression and the increased expression of ra-ncRNA reads in HIP and CER, as well as an increased number of mtR-NA-associated reads in HIP. We also observed the appearance of sense-intronic ncRNAs-in females, in HIP and FC, and in males, in CER. In this work, we also show that tRNA-GlyGCC and tRNA-GlyCCC are most frequently processed to tRFs, in CER in females, as compared to males. An analysis of the targeted pathways revealed that tRFs and snoRFs in scatter radiation samples mapped to genes in several pathways associated with various neuronal functions. While in HIP and CER these pathways were underrepresented, in FC, they were overrepresented. Such changes may play an important role in pathologies that develop in response to scatter radiation, the effect known as "radio-brain", and may in part explain the sex-specific differences observed in animals and humans exposed to radiation and scatter radiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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