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Enregistrement W4304809026 · doi:10.21203/rs.3.rs-2143064/v1

Phosphoethanolamine reverses aberrant DNA methylation in non-alcoholic steatohepatitis caused by Pcyt2 deficiency 

2022· preprint· en· W4304809026 sur OpenAlexafffund
Sophie Grapentine, Prasoon Agarwal, Vern Dolinsky, Marica Bakovic

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDNA methylationSteatohepatitisEpigeneticsBiologyMethylationFatty liverEnergy homeostasisBiochemistryInternal medicineGene expressionGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Accumulating evidence links disruptions in phospholipid homeostasis to obesity, type 2 diabetes, and fatty liver diseases. Mice with a heterozygous ablation of the phosphatidylethanolamine (PE) synthesizing enzymePcyt2+/−show reduced PE synthesis and turnover and develop an age-dependent metabolic syndrome that is characterized by impaired fatty acid and glucose metabolism, hypertriglyceridemia, insulin resistance, obesity, and all characteristics of NASH. Aberrant DNA methylation can lead to the onset of pathological phenotypes and is increasingly being implicated in age-related metabolic diseases, including NASH. The methylation of PE to phosphatidylcholine (PC) is a major consumer of liver S-adenosyl methionine (SAM) and thus, alterations in PE metabolism have the potential to influence DNA methylation by modulating SAM availability. Here, we hypothesize that abnormal DNA methylation patterns underly the development ofPcyt2+/−NASH. We conduct an epigenome-wide methylation analysis to determine differential methylation and investigate whether treatment with the Pcyt2 substrate phosphoethanolamine (PEtn) for 8 weeks can reverse aberrant DNA methylation through the stimulation PE synthesis. ResultsPcyt2+/−NASH liver experiences significant alterations in DNA hypo- and hypermethylation relative toPcyt2+/+. Differentially methylated genes belong to pathways including PI3K-Akt signalling pathway, Foxo signalling pathway, oxidative phosphorylation and insulin signalling/secretion indicating that epigenetic regulation underlies many of our previously established pathological mechanisms ofPcyt2+/−NASH. Previously unidentified pathways during Pcyt2 deficiency are highlighted such as cell cycle regulation and cellular senescence that may contribute to NASH development. Treatment with PEtn dramatically reverses aberrant total and protein-coding DNA methylation patterns by 96%. PEtn treatment restored the methylation status of key genes involved in epigenetic modifications and induced differential methylation of genes associated with obesity and T2DM such asAdyc3, Celsr2, Fam63b.Conclusion ThePcyt2+/−liver methylome and transcriptome is altered and likely underlies much of the pathology inPcyt2+/−NASH phenotype. PEtn significantly attenuates aberrant DNA methylation inPcyt2+/−liver by stimulating the CDP:Ethanolamine Kennedy pathway and corrects the epigenetic regulation of genes involved in the pathogenesis of NASH, showing its therapeutic potential. This analysis provides critical insight into the epigenetic basis of NASH pathophysiology and suggests diagnostic markers and therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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