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Enregistrement W4304890961 · doi:10.1038/s41467-022-33760-5

A predictive computational platform for optimizing the design of bioartificial pancreas devices

2022· article· en· W4304890961 sur OpenAlexafffund
Alexander U. Ernst, Long‐Hai Wang, Scott C. Worland, Braulio A. Marfil‐Garza, Xi Wang, Wanjun Liu, Alan Chiu, Tatsuya Kin, Doug O’Gorman, Scott Steinschneider, Ashim K. Datta, Klearchos K. Papas, A. M. James Shapiro, Minglin Ma

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNovo NordiskJuvenile Diabetes Research Foundation United States of AmericaNational Science FoundationNational Institutes of HealthUniversity of Alberta
Mots-clésComputer scienceEquivalence (formal languages)IsletInsulinMathematicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The delivery of encapsulated islets or stem cell-derived insulin-producing cells (i.e., bioartificial pancreas devices) may achieve a functional cure for type 1 diabetes, but their efficacy is limited by mass transport constraints. Modeling such constraints is thus desirable, but previous efforts invoke simplifications which limit the utility of their insights. Herein, we present a computational platform for investigating the therapeutic capacity of generic and user-programmable bioartificial pancreas devices, which accounts for highly influential stochastic properties including the size distribution and random localization of the cells. We first apply the platform in a study which finds that endogenous islet size distribution variance significantly influences device potency. Then we pursue optimizations, determining ideal device structures and estimates of the curative cell dose. Finally, we propose a new, device-specific islet equivalence conversion table, and develop a surrogate machine learning model, hosted on a web application, to rapidly produce these coefficients for user-defined devices.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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