Fish length back-calculation from scales: advancing methodology and correction of bias
Notice bibliographique
Résumé
Fish length back-calculation from hard structures (e.g., scales, otoliths, spines, etc.) is a commonly used method to reconstruct individual growth rates and sizes at age/stage in the absence of an intensive sampling–resampling timeseries. However, reliable estimates via these methods require the empirical validation of multiple assumptions about the growth of these hard structures. Here, we focus on reducing bias in scale-based back-calculations and validating proposed improvements using archived scales from a wild population of anadromous steelhead trout ( Oncorhynchus mykiss). We first describe a series of back-calculation problems and propose solutions that can be integrated into common back-calculation methods. We then compare back-calculation accuracy, precision, and bias between proposed solutions and traditional forms of two back-calculation methods: Fraser–Lee and Body-Proportional. We discovered that the assumption that rapid growth begins immediately after juvenile steelhead pass downstream of the fish fence (300 m upstream of the ocean) was invalid and required a correction factor to prevent overestimating fish length by an average of 14%. The proposed modified methods we described performed better than traditional back-calculation methods. Overall, these findings can improve estimates of fish length from scale-based back-calculations and illustrate the importance of validating key assumptions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,036 | 0,159 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».