Operculina and Neoassilina: A Revision of Recent Nummulitid Genera Based on Molecular and Morphological Data Reveals a New Genus
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The genus Operculina , a large symbiont-bearing benthic foraminifer, is characterized by high morphological variability showing thick involute to intermediate semi-involute to flat evolute tests. Different morphotypes are either considered as ecophenotypes or distinct species. In order to test the hypothesis of ecophenotypes versus different species, a single cell high throughput sequencing approach was applied to assess the interspecific diversity of Operculina . This results in two groups of ribotypes, one corresponding to Operculina ammonoides / Operculina discoidalis , the other containing Operculina complanata / Operculina elegans . These groups can also be separated morphologically. Therefore, O. complanata and O. elegans represent a single species and the latter can be regarded as a junior synonym of O. complanata. Operculina ammonoides and O. discoidalis also form a single species, which makes the latter a junior synonym of O. ammonoides . Because generic differences in Operculina species are manifested in morphology and molecular genetics, the genus Neoassilina with the designated species Neoassilina ammonoides is installed. Additional analysis of ribosomal SSU rDNA data of eight recent nummulitid genera confirms the obtained high troughput sequencing results and further shows that Palaeonummulites venosus builds a clade with O. complanata that branches at the base of other Nummulitidae containing Planostegina , Planoperculina , Cycloclypeus , Heterostegina , Operculinella and Neoassilina .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».