Thermophilic Dehalococcoidia with unusual traits shed light on an unexpected past
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The phylum Chloroflexota is ubiquitous; however, its biology and evolution are poorly understood due to limited cultivability. Here, we isolated two motile, thermophilic bacteria from hot spring sediments belonging to the class Dehalococcoidia within the phylum Chloroflexota . A combination of cryo-electron tomography, exometabolomics, and cultivation experiments using stable isotopes of carbon revealed three unusual traits: flagellar motility; a peptidoglycan-containing cell envelope; and heterotrophic activity on aromatics and plant-associated compounds. Although these traits are unusual among cultivated Chloroflexota and Dehalococcoidia , ancestral character state reconstructions showed flagellar motility and peptidoglycan-containing cell envelopes were ancestral within the Dehalococcoidia and subsequently lost prior to a major adaptive radiation of Dehalococcoidia into marine environments. This evolutionary past explains the widespread genomic potential to degrade terrestrial organic matter among marine Dehalococcoidia and raises new questions about the timing and selective forces driving their successful niche expansion into the global oceans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».