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Enregistrement W4306810389 · doi:10.1093/jxb/erac422

<i>N</i> -Hydroxy pipecolic acid methyl ester is involved in Arabidopsis immunity

2022· article· en· W4306810389 sur OpenAlexafffund
Lennart Mohnike, Weijie Huang, Brigitte Worbs, Kirstin Feussner, Yuelin Zhang, Ivo Feußner

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship CouncilDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésChemistryArabidopsisMetaboliteMutantTandem mass spectrometryBiochemistryPipecolic acidMoietyStereochemistryMass spectrometryChromatographyAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The biosynthesis of N-hydroxy pipecolic acid (NHP) has been intensively studied, though knowledge on its metabolic turnover is still scarce. To close this gap, we discovered three novel metabolites via metabolite fingerprinting in Arabidopsis thaliana leaves after Pseudomonas infection and UV-C treatment. Exact mass information and fragmentation by tandem mass spectrometry (MS/MS) suggest a methylated derivative of NHP (MeNHP), an NHP-OGlc-hexosyl conjugate (NHP-OGlc-Hex), and an additional NHP-OGlc-derivative. All three compounds were formed in wild-type leaves but were not present in the NHP-deficient mutant fmo1-1. The identification of these novel NHP-based molecules was possible by a dual-infiltration experiment using a mixture of authentic NHP and D9-NHP standards for leaf infiltration followed by UV-C treatment. Interestingly, the signal intensity of MeNHP and other NHP-derived metabolites increased in ugt76b1-1 mutant plants. For MeNHP, we unequivocally determined the site of methylation at the carboxylic acid moiety. MeNHP application by leaf infiltration leads to the detection of a MeNHP-OGlc as well as NHP, suggesting MeNHP hydrolysis to NHP. This is in line with the observation that MeNHP infiltration is able to rescue the fmo1-1 susceptible phenotype against Hyaloperonospora arabidopsidis Noco 2. Together, these data suggest MeNHP as an additional storage or transport form of NHP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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