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Enregistrement W4306896990 · doi:10.1371/journal.pone.0274381

Autoantibody profile in sarcoidosis, analysis from the GRADS sarcoidosis cohort

2022· article· en· W4306896990 sur OpenAlexfundno aff
Basheer Khassawneh, Chengsong Zhu, Briana Barkes, Brian Vestal, Sarah Shrock, May Gillespie, Karin Pacheco, Kevin D. Deane, Lisa A. Maier, Quan‐Zhen Li, Nabeel Hamzeh

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSarcoidosis and Beryllium Toxicity Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteHealth Sciences, University of ArizonaUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignLouisiana Transportation Research CenterUniversity of South CarolinaYork UniversityYale UniversityVanderbilt UniversityUniversity of PennsylvaniaUniversity of PittsburghJohns Hopkins UniversityNational Jewish HealthUniversity of California, San FranciscoBritton Fund
Mots-clésSarcoidosisAutoantibodyMedicineImmunologyCohortPathogenesisSystemic diseasePathologyAntibodyImmunopathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Sarcoidosis, a multi-systemic granulomatous disease, is a predominantly T-cell disease but evidence for a role for humoral immunity in disease pathogenesis is growing. Utilizing samples from the Genomic Research in Alpha-1 anti-trypsin Deficiency and Sarcoidosis (GRADS) study, we examined the prevalence of autoantibodies in sarcoidosis patients with pulmonary-only and extra-pulmonary organ involvement compared to normal controls. STUDY DESIGN AND METHODS: We analyzed serum samples from sarcoidosis patients who participated in the GRADS study utilizing an autoantigen microarray platform for both IgM and IgG antibodies. The cohort included sarcoidosis patients with pulmonary-only disease (POS, n = 106), sarcoidosis patients with extra-pulmonary disease (EPS, n = 120) and a normal control cohort (NC, n = 101). Organ involvement was assessed following a standardized format across all GRADS participating centers. RESULTS: Sarcoidosis patients overall had increased levels of IgM and IgG autoantibodies compared to normal controls. In addition, several autoantibodies were elevated in the POS and EPS cohorts compared to the NC cohort. Differences in autoantibody levels were also noted between the POS and the EPS cohorts. When comparing organ involvement with sarcoidosis, bone, spleen and ear, nose and throat involvement had higher IgM expression than other organs. CONCLUSION: Sarcoidosis patients have elevated IgM and IgG autoantibody levels compared to normal controls. In addition, individuals with pulmonary as well as additional organ involvement had higher IgM expression. Further research is needed focusing on specific organ-autoantibody pairs and role of autoantibodies in disease pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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