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Enregistrement W4306898524 · doi:10.1371/journal.pone.0276384

BNT162b2 against COVID-19 in Brazil using a test-negative design: Study protocol and statistical analysis plan

2022· article· en· W4306898524 sur OpenAlexaff
Régis Goulart Rosa, Júlia Spinardi, Kristen E. Allen, Joselia Larger Manfio, Cintia Laura Pereira de Araújo, Mírian Cohen, Caroline Cabral Robinson, Daniel Sganzerla, Diogo Cunha Ferreira, Emanuel Maltempi de Souza, Jaqueline Carvalho de Oliveira, Daniela Fiori Gradia, Ana Paula Carneiro Brandalize, Gabriela Almeida Kucharski, Fernando Pedrotti, Cristina de Oliveira Rodrigues, Moe H. Kyaw, Graciela del Carmen Morales Castillo, Amit Srivastava, John M. McLaughlin, Maicon Falavigna

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensMcMaster UniversityImpact
Organismes subventionnairesPfizer
Mots-clésMedicineProtocol (science)VaccinationFamily medicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Test (biology)Clinical trialResearch ethicsMEDLINEHealth careSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Trial registrationInstitutional review boardInternal medicineAlternative medicineImmunologyPathologySurgeryInfectious disease (medical specialty)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Real-world data on COVID-19 vaccine effectiveness are needed to validate evidence from randomized clinical trials. Accordingly, this study aims to evaluate, in a real-world setting in Brazil, the effectiveness of Pfizer-BioNTech BNT162b2 against symptomatic COVID-19 and COVID-19-related complications across diverse populations. MATERIALS AND METHODS: A test-negative case-control study with follow-up of cases is currently being conducted in Toledo, a city in southern Brazil, following a mass COVID-19 vaccination campaign with BNT162b2. The study is being conducted among patients aged 12 years or older seeking care in the public health system with acute respiratory symptoms and tested for SARS-CoV-2 on reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Cases are RT-PCR positive and controls RT-PCR negative. Test-positive cases are prospectively followed through structured telephone interviews performed at 15 days post-enrollment, and at 1, 3, 6, 9 and 12 months. Baseline demographic, clinical, and vaccination data are being collected by means of structured interviews and medical registry records reviews at the time of enrollment. All RT-PCR-positive samples are screened for mutations to identify SARS-CoV-2 variants. ETHICS AND DISSEMINATION: The study protocol has been approved by the research ethics committee of all participant sites. Study findings will be disseminated through peer-reviewed publications and conference presentations. TRAIL REGISTRATION: Clinicatrials.gov: NCT05052307.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,076
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,083
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,402

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0760,083
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0230,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,203
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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