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Enregistrement W4306914059 · doi:10.1089/vbz.2022.0036

Emerging Tick-Borne Pathogens in Central Canada: Recent Detections of <i>Babesia odocoilei</i> and <i>Rickettsia rickettsii</i>

2022· article· en· W4306914059 sur OpenAlexaffabout
Kirsten E. Crandall, Jeremy T. Kerr, Virginie Millien

Notice bibliographique

RevueVector-Borne and Zoonotic Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAnaplasma phagocytophilumRickettsia rickettsiiIxodes scapularisTickBorrelia burgdorferiBabesiaTick-borne diseaseBorreliaVirologySpotted feverIxodidaeRickettsiaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The spread of emerging tick-borne pathogens has steadily increased in Canada with the widespread establishment of tick vectors and vertebrate hosts. At present, Borrelia burgdorferi , the bacterium causing Lyme disease, is the most common tick-borne pathogen in Canada and primarily transmitted by Ixodes scapularis . A low prevalence of other emerging tick-borne pathogens, such as Anaplasma phagocytophilum , Babesia species, Borrelia miyamotoi , and Francisella tularensis have also been detected through surveillance efforts in Canada. Although Rickettsia rickettsii has been historically detected in Haemaphysalis leporispalustris in Canada, the current prevalence and geographic extent of this pathogen is unknown. Material and Methods: In this study, we assessed the presence and prevalence of several emerging tick-borne pathogens in ticks and hosts collected through tick dragging and small mammal trapping in Central Canada. Results: Nested PCR testing detected three pathogen species in ticks, with Babesia odocoilei and B. burgdorferi in I. scapularis in addition to R. rickettsii in H. leporispalustris . Three pathogen species were detected in small mammals by nested PCR including B. odocoilei in Blarina brevicauda , Babesia microti in Peromyscus leucopus , and a Hepatozoon species in P. leucopus and Peromyscus maniculatus . B. burgdorferi and Babesia species were the pathogens most often detected in our samples, suggesting they are widely distributed across Central Canada. We also detected B. odocoilei and R. rickettsii beyond their known geographic distribution. Conclusions: Our results provide evidence that emerging tick-borne pathogens may be present outside defined risk areas identified by current surveillance efforts in Canada. As a result, emerging tick-borne pathogens introduced by the dispersal of infected ticks by migratory birds or maintained by hosts and vectors through cryptic transmission cycles may go undetected. More comprehensive testing including all tick life stages and additional tick-borne pathogens will help detect the spread and potential risk of emerging or re-emerging tick-borne pathogens for human and wildlife populations throughout Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,135
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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