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Enregistrement W4306914348 · doi:10.1109/tmi.2022.3213983

Learn2Reg: comprehensive multi-task medical image registration challenge, dataset and evaluation in the era of deep learning

2023· article· en· W4306914348 sur OpenAlexfundno aff
Alessa Hering

Notice bibliographique

RevueUniversity of Birmingham Research Portal (University of Birmingham) · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMenzies Centre for Australian Studies, King's College London, University of LondonComputer Science and Artificial Intelligence Laboratory, Massachusetts Institute of TechnologyStanford Bio-XGillings School of Public HealthHaute école Spécialisée de Suisse OccidentaleNanjing UniversityConcordia UniversityNvidiaRadboud Universitair Medisch CentrumUppsala UniversitetAthinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General HospitalCentre National de la Recherche ScientifiqueTel Aviv UniversityImperial College LondonCentre d'Imagerie BioMédicaleUniversität zu LübeckUniversité Paris-SaclayTsinghua UniversityUniversity of North Carolina at Chapel HillNanjing University of Information Science and TechnologyWuhan National Laboratory for OptoelectronicsElektaRadboud UniversiteitChinese University of Hong KongBundesministerium für Bildung und ForschungHuazhong University of Science and TechnologyInstitut Gustave-RoussyVanderbilt UniversityKing's College LondonInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAkademia Górniczo-Hutnicza im. Stanislawa StaszicaMassachusetts General Hospital
Mots-clésImage registrationArtificial intelligenceComputer scienceDeep learningTask (project management)Computer visionMedical imagingImage (mathematics)Engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Image registration is a fundamental medical image analysis task, and a wide variety of approaches have been proposed. However, only a few studies have comprehensively compared medical image registration approaches on a wide range of clinically relevant tasks. This limits the development of registration methods, the adoption of research advances into practice, and a fair benchmark across competing approaches. The Learn2Reg challenge addresses these limitations by providing a multi-task medical image registration data set for comprehensive characterisation of deformable registration algorithms. A continuous evaluation will be possible at https:// learn2reg.grand-challenge.org. Learn2Reg covers a wide range of anatomies (brain, abdomen, and thorax), modalities (ultrasound, CT, MR), availability of annotations, as well as intra- and inter-patient registration evaluation. We established an easily accessible framework for training and validation of 3D registration methods, which enabled the compilation of results of over 65 individual method submissions from more than 20 unique teams. We used a complementary set of metrics, including robustness, accuracy, plausibility, and runtime, enabling unique insight into the current state-of-the-art of medical image registration. This paper describes datasets, tasks, evaluation methods and results of the challenge, as well as results of further analysis of transferability to new datasets, the importance of label supervision, and resulting bias. While no single approach worked best across all tasks, many methodological aspects could be identified that push the performance of medical image registration to new state-of-the-art performance. Furthermore, we demystified the common belief that conventional registration methods have to be much slower than deep-learning-based methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,026
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,026
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0070,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0070,007
Intégrité de la recherche0,0080,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations229
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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