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Enregistrement W4307034964 · doi:10.1002/bmc.5531

Is nontargeted data acquisition for target analysis (nDATA) in mass spectrometry a forward‐thinking analytical approach?

2022· article· en· W4307034964 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiomedical Chromatography · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesUniversité de MontréalNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésMass spectrometryChemistrySelected reaction monitoringSoftwareResolution (logic)Data acquisitionPerspective (graphical)TRACE (psycholinguistics)Computer scienceData miningData scienceChromatographyTandem mass spectrometryArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Targeted mass spectrometry is extensively used for the quantitative measurement of various molecules present in complex matrices. It is certainly one of the most important analytical duties in a mass spectrometry laboratory. Systematic development of selected‐reaction monitoring (SRM), multiple‐reaction monitoring (MRM) and parallel‐reaction monitoring (PRM) methods for targeted mass spectrometry‐based analysis was performed without considering future opportunities. The advancement of hardware and software technologies has resulted in greater resolution, accuracy, speed and depth. For sure, SRM, MRM or PRM acquisitions can quantify molecules very accurately at trace levels. However, they do not provide datasets allowing future data mining. Obviously, we cannot truly quantify something that we do not know is there. However, using non‐targeted data acquisition for target analysis, we can generate a MS 1 and MS 2 digital libraries of each sample, providing future proof datasets. This is instrumental for data mining following new questions potentially arising in time permitting new and deeper processing and interpretation. This perspective article provides thoughts on why we believe it is time to question the status quo in targeted mass spectrometry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,725
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,008
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle