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Enregistrement W4307122790 · doi:10.3390/cancers14215197

Interaction of HPV16 and Cutaneous HPV in Head and Neck Cancer

2022· article· en· W4307122790 sur OpenAlexafffundabout
Walid A. Al‐Soneidar, Sam Harper, Babatunde Y. Alli, Belinda Nicolau

Notice bibliographique

RevueCancers · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOdds ratioConfidence intervalMedicineHead and neck cancerGenotypeInternal medicineHPV infectionLogistic regressionCancerHuman papillomavirusOncologyDermatologyGastroenterologyCervical cancerBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Human papillomavirus 16 (HPV16) is an established risk factor for Head and Neck Cancer (HNC). Recent reports have shown that genotypes from the beta (β) and gamma (γ) genera, also known as cutaneous HPV, can be found in the oral cavity, but their role is largely unidentified. We investigated the interaction between oral HPV16 and cutaneous HPV in HNC. METHODS: = 423) from the HeNCe Life study in Montreal, Canada. Participants were tested for alpha HPV and cutaneous genera using oral mouth rinse and brush samples. We used unconditional logistic regression to obtain adjusted odds ratios (aOR) and 95% confidence interval (CI) as a measure of the effect between HPV and HNC and assessed the interaction between HPV genotypes on the multiplicative and additive scales. RESULTS: Prevalence of HPV infection was higher among cases (73%) than controls (63.4%), with cases more likely to be coinfected with more than a single genotype, 52.9% vs. 43.5%, respectively. Infection with HPV16 alone had a strong effect on HNC risk aOR = 18.2 [6.2, 53.2], while infection with any cutaneous HPV, but not HPV16, appeared to have the opposite effect aOR = 0.8 [0.6, 1.1]. The observed effect of joint exposure to HPV16 and any cutaneous HPV (aOR = 20.4 [8.3, 50.1]) was stronger than the expected effect based on an assumption of independent exposures but was measured with considerable imprecision. While the point estimate suggests a positive interaction between HPV16 and cutaneous HPV, results were imprecise with relative excess risk due to interaction (RERI) = 2.4 [-23.3, 28.2]. CONCLUSION: There could be biologic interaction between HPV16 and genotypes from cutaneous genera, which warrants further investigation. Although cutaneous HPVs are not usually found in tumor tissues, they are cofactors that could interact with HPV16 in the oral cavity and thus strengthen the latter's carcinogenic effect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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