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Enregistrement W4307138427 · doi:10.1038/s41598-022-22307-9

Vitamin D enhances type I IFN signaling in COVID-19 patients

2022· article· en· W4307138427 sur OpenAlexaff
Shirin Hafezi, Fatemeh Saheb Sharif‐Askari, Narjes Saheb Sharif‐Askari, Hawra Ali Hussain Alsayed, Habiba Alsafar, Fatme Al Anouti, Qutayba Hamid, Rabih Halwani

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHazard ratioVitamin D and neurologyConfidence intervalInternal medicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Intensive care unitSalivaImmunologyGastroenterologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of Vitamin D (VitD) to modulate antiviral responses through induction of antimicrobial peptide is well established. However, the effect of VitD on host responses to SARS-CoV-2 is not well investigated. We here report the ability of VitD to enhance host IFN-alpha/beta (a/β) signaling both in vitro and among severe COVID-19 patients treated with VitD. Blood and saliva specimens were obtained from severe COVID-19 patients treated (43 patients), or not (37 patients), with vitD, during their stay in intensive care unit. Patients were followed up to 29 days following admission, and patient survival outcomes were collected. Higher activity levels of RIG-1/MDA-5 and JAK-STAT signaling pathways were observed with significantly higher gene and protein levels of antiviral interferon stimulating genes (ISGs) such as MX-1 and ISG-15; both in vitro, following treatment of PBMCs with vitD, and in whole blood and saliva specimens of VitD treated patients. Moreover, VitD treated patients had lower risk of all-cause mortality by day 29 compared to untreated patients (adjusted hazard ratio, 0.37, 95% confidence interval of 0.14-0.94; P = 0.038). The herein uncovered regulatory role of VitD on type I IFNs suggests the importance of insuring a normal level of VitD for the prevention and probably treatment of SARS-CoV-2 infection. Additional mechanistic studies, however, are needed to fully elucidate the antiviral effects of VitD particularly in the setting of COVID-19 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,360 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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