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Enregistrement W4307171297 · doi:10.3390/tropicalmed7100324

Crimean–Congo Hemorrhagic Fever Virus Survey in Humans, Ticks, and Livestock in Agnam (Northeastern Senegal) from February 2021 to March 2022

2022· article· en· W4307171297 sur OpenAlexfundno aff
Moufid Mhamadi, Aminata Badji, Idrissa Dieng, Alioune Gaye, El Hadji Ndiaye, Mignane Ndiaye, Moundhir Mhamadi, Cheikh Talibouya Touré, Mouhamed Rassoul Mbaye, Mamadou Aliou Barry, Oumar Ndiaye, Babacar Faye, Fatimata Amadou Ba, Boly Diop, Mamadou Ndiaye, Mathioro Fall, Samba Niang Sagne, Gamou Fall, Cheikh Loucoubar, Hugues Fausther‐Bovendo, Amadou Alpha Sall, Gary Kobinger, Ousmane Faye, Mawlouth Diallo, Oumar Faye

Notice bibliographique

RevueTropical Medicine and Infectious Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research Centre
Mots-clésLivestockVeterinary medicineTickCrimean–Congo hemorrhagic feverBiologyVirologyMedicineEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crimean–Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) is widespread in Asia, Europe, and Africa. In Senegal, sporadic cases of CCHFV have been reported since 1960. Bordering Mauritania in northeastern Senegal, Agnam is an arid area in the region of Matam where CCHFV is endemic, which harbors a pastoralist community. Given the drought conditions of Agnam, inhabitants are in constant movement with their animals in search of pasture, which brings them into contact with pathogens such as arboviruses. To identify CCHFV in this area, we established a One Health site in order to analyze animal livestock, ticks and human samples collected over a one-year period by qRT-PCR and ELISA. Our analysis showed one (1/364) patient carried anti-CCHFV IgM and thirty-seven carried anti-CCHFV IgG (37/364). In livestock, anti-CCHFV IgG was detected in 13 (38.24%) of 34 sentinel sheep. The risk of CCHFV infection increased significatively with age in humans (p-value = 0.00117) and sheep (p-value = 1.18 × 10−11). Additional risk factors for CCHFV infection in sheep were dry seasons (p-value = 0.004) and time of exposure (p-value = 0.007). Furthermore, we detected a total of three samples with CCHFV RNA within Rhipicephalus evertsi evertsi and Rhipicephalus guilhoni tick species. Our results highlighted the usefulness of a One Health survey of CCHFV in pastoral communities at risk of arboviruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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