The Expression Patterns of Human Cancer-Testis Genes Are Induced through Epigenetic Drugs in Colon Cancer Cells
Notice bibliographique
Résumé
Background: The expression of human germline genes is restricted to the germ cells of the gonads, which produce sperm and eggs. The germline genes involved in testis development and potentially activated in cancer cells are known as cancer-testis (CT) genes. These genes are potential therapeutic targets and biomarkers, as well as drivers of the oncogenic process. CT genes can be reactivated by treatment with drugs that demethylate DNA. The majority of the existing literature on CT gene activation focuses on X-chromosome-produced CT genes. We tested the hypothesis that epigenetic landscape changes, such as DNA methylation, can alter several CT gene expression profiles in cancer and germ cells. Methods: Colon cancer (CC) cell lines were treated with the DNA methyltransferase inhibitor (DNMTi) 5-aza-2’-deoxycytidine, or with the histone deacetylase inhibitor (HDACi) trichostatin A (TSA). The effects of these epigenetic treatments on the transcriptional activation of previously published CT genes (CTAG1A, SCP2D1, TKTL2, LYZL6, TEX33, and ACTRT1) and testis-specific genes (NUTM1, ASB17, ZSWIM2, ADAM2, and C10orf82) were investigated. Results: We found that treatment of CC cell lines with 5-aza-2’-deoxycytidine or TSA correlated with activation of X-encoded CT genes and non-X-encoded CT genes in somatic (non-germline) cells. Conclusion: These findings confirm that a subset of CT genes can be regulated by hypomethylating drugs and subsequently provide a potential therapeutic target for cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».