ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit
Notice bibliographique
Résumé
high-risk genotype develop kidney disease. As APOL1 gene expression correlates closely with the degree of kidney cell injury in both cell and animal models, the mechanisms regulating APOL1 expression may be critical determinants of risk allele penetrance. The APOL1 messenger RNA includes Alu elements at the 3' untranslated region that can form a double-stranded RNA structure (Alu-dsRNA) susceptible to posttranscriptional adenosine deaminase acting on RNA (ADAR)-mediated adenosine-to-inosine (A-to-I) editing, potentially impacting gene expression. We studied the effects of ADAR expression and A-to-I editing on APOL1 levels in podocytes, human kidney tissue, and a transgenic APOL1 mouse model. In interferon-γ (IFN-γ)-stimulated human podocytes, ADAR down-regulates APOL1 by preventing melanoma differentiation-associated protein 5 (MDA5) recognition of dsRNA and the subsequent type I interferon (IFN-I) response. Knockdown experiments showed that recognition of APOL1 messenger RNA itself is an important contributor to the MDA5-driven IFN-I response. Mathematical modeling suggests that the IFN-ADAR-APOL1 network functions as an incoherent feed-forward loop, a biological circuit capable of generating fast, transient responses to stimuli. Glomeruli from human kidney biopsies exhibited widespread editing of APOL1 Alu-dsRNA, while the transgenic mouse model closely replicated the edited sites in humans. APOL1 expression in mice was inversely correlated with Adar1 expression under IFN-γ stimuli, supporting the idea that ADAR regulates APOL1 levels in vivo. ADAR-mediated A-to-I editing is an important regulator of APOL1 expression that could impact both penetrance and severity of APOL1-associated kidney disease.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».