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Enregistrement W4307414333 · doi:10.1101/2022.10.23.22281418

The association between mitochondrial DNA copy number, low-density lipoprotein cholesterol, and cardiovascular disease risk

2022· preprint· en· W4307414333 sur OpenAlexaff
Xue Liu, Xianbang Sun, Yuankai Zhang, Wenqing Jiang, Lai Meng, Kerri L. Wiggins, Laura M. Raffield, Lawrence F. Bielak, Wei Zhao, Achilleas Pitsillides, Jeffrey Haessler, Yinan Zheng, Thomas W. Blackwell, Jie Yao, Xiuqing Guo, Yong Qian, Bharat Thyagarajan, Nathan Pankratz, Stephen S. Rich, Kent D. Taylor, Patricia A. Peyser, Susan R. Heckbert, Sudha Seshadri, Eric Boerwinkle, Megan L. Grove, Nicholas B. Larson, Jennifer A. Smith, Ramachandran S. Vasan, Annette L. Fitzpatrick, Myriam Fornage, Jun Ding, April P. Carson, Gonçalo R. Abecasis, Josée Dupuis, Alex P. Reiner, Charles Kooperberg, Lifang Hou, Bruce M. Psaty, James G. Wilson, Daniel Levy, Jerome I. Rotter, Joshua C. Bis, Claudia L. Satizábal, Dan E. Arking, Chunyu Liu

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésMendelian randomizationMitochondrial DNAHaplogroupInternal medicineDiseaseGeneticsAlleleMitochondrionMedicineBiologyEndocrinologyCardiologyGeneHaplotypeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mitochondria are the primary organelle to generate cellular energy. Our group and others have reported that lower mitochondrial DNA copy number (mtDNA CN) is associated with higher risk of cardiovascular disease outcomes (CVD) and higher LDL levels. However, the causal relationship between mtDNA CN and CVD remains to be studied. Here we performed cross-sectional and prospective association analyses of blood-derived mtDNA CN and CVD outcomes in up to 27,316 participants from different racial/ethnic groups with whole genome sequencing. We validated most of the previously reported associations but effect sizes were smaller in this study. For example, one SD unit decrease in mtDNA CN was significantly associated with 1.08-fold (95% CI, 1.04, 1.12; P =1.7E-04) hazard for developing incident coronary heart disease (CHD) adjusting for age, sex and race/ethnicity. We conducted Mendelian randomization (MR) to explore causal relationships between mtDNA CN, LDL, and CHD. Bi-directional univariable MR analyses provided strong evidence indicating higher LDL level is causally associated with lower mtDNA CN, and CHD was weakly associated with lower mtDNA CN. We found no evidence supporting a causal association for lower mtDNA CN with higher CHD risk or higher LDL. In multivariable MR, no associations were observed between mtDNA CN and CHD controlling for LDL level (P =0.92), whereas strong evidence for a direct causal effect was found for higher LDL on lower mtDNA CN, adjusting for CHD status (P =8.3E-10). Findings from this study indicate high LDL underlies the complex relationships between vascular atherosclerosis and lower mtDNA CN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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