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Enregistrement W4307425168 · doi:10.1139/cjm-2022-0074

Neighbours in nodules: the interactions between <i>Frankia</i> sp. ACN10a and non-<i>Frankia</i> nodular endophytes of alder

2022· article· en· W4307425168 sur OpenAlexafffundvenue
Louis Garneau, Pascale B. Beauregard, Sébastien Roy

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesUniversité Laval
Mots-clésFrankiaBiologyAlderSymbiosisMicrobiologyBotanyRoot noduleBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the present study, we report the in vitro interactions between Frankia sp. ACN10a and non- Frankia nodular endophytes (NFNE) isolated from alder. The supernatant of NFNE grown in nitrogen-replete medium had neutral or negative effects on Frankia growth; none had a stimulatory effect. Inhibitory effects were observed for supernatants of some NFNE, notably Micromonospora, Pseudomonas, Serratia and Stenotrophomonas isolates. However, some NFNE– Frankia coculture supernatants could stimulate Frankia growth when used as a culture medium supplement. This was observed for supernatants of Frankia cocultured with Microvirga and S treptomyces isolates. In nitrogen-limited conditions, cocultures of Frankia with some NFNE, including some rhizobia and Cytobacillus, resulted in higher total biomass than Frankia-only cultures, suggesting cooperation, while other NFNE were strongly antagonistic. Microscopic observation of cocultures also revealed compromised Frankia membrane integrity, and some differentiation into stress resistance-associated morphotypes such as sporangia and reproductive torulose hyphae (RTH). Furthermore, the coculture of Frankia with Serratia sp. isolates resulted in higher concentrations of the auxinic plant hormone indole-3-acetic acid and related indolic compounds in the culture supernatant. This study sheds new light on the breadth of microbial interactions that occur amongst bacteria that inhabit the understudied ecological niche of the alder nodule.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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