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Enregistrement W4307451010 · doi:10.1101/2022.10.18.512735

Inhibition of GCN5 decreases skeletal muscle fat metabolism during high fat diet feeding

2022· preprint· en· W4307451010 sur OpenAlexafffund
Alex E. Green, Brayden L. Perras, Hongbo Zhang, Elena Katsyuba, Alaa Haboush, Kwadjo M. Nyarko, Dheeraj K. Pandey, Abolfazl Nik-Akhtar, Dongryeol Ryu, Johan Auwerx, Keir J. Menzies

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Science Foundation of Guangdong ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Science and ICT, South KoreaÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneUniversity of Ottawa
Mots-clésSkeletal muscleMyogenesisInternal medicineEndocrinologyBiologyPCAFCitrate synthaseMetabolismMitochondrionCell biologyBiochemistryGeneEnzymeTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction GCN5 ( Kat2a ) is a lysine acetyl transferase capable of acetylating and inhibiting PGC-1α activity. As such, it is described as a negative regulator of PGC-1α and subsequently restricts mitochondrial content. However, elimination of GCN5 in skeletal muscle does not increase mitochondrial content or alter lipid metabolism under normal metabolic conditions. GCN5 levels increase with high-fat diet (HFD) feeding in rodents. Additionally, the GCN5 homolog, PCAF, has previously been shown to also acetylate and inhibit PGC-1α and therefore may possibly compensate for loss of GCN5. Objective The objective of this study was to examine if with HFD feeding that elimination of GCN5 ( Kat2a gene) from skeletal muscle would elicit improvements in mitochondrial and metabolic markers. Methods Skeletal muscle specific GCN5 knockouts ( Gcn5 skm-/- ) were fed an HFD. Body composition, cardio-metabolic and physical fitness outcomes were monitored. Additionally, cultured myotubes were treated with a pan-GCN5/PCAF inhibitor and examined for changes in mitochondrial markers. Results Elimination of skeletal muscle GCN5 did not alter body composition, tissue masses, energy intake, or energy expenditure measurements of mice fed an HFD. Furthermore, whole body glucose homeostasis and cardiac measurements were not altered. There were few differences in lipid metabolism genes, relatively more glucose oxidation versus Gcn5 skm+/+ (wildtype) mice, and a reduction in Pdk4 expression. Exercise capacity and mitochondrial content levels were not altered in Gcn5 skm-/- mice. Further, elimination of GCN5 in skeletal muscle increased Kat2b (PCAF) mRNA expression; however, inhibition of GCN5/PCAF bromodomains in cultured myotubes did not increase oxidative metabolism genes and decreased expression of some mitochondrial genes and Pdk4 mRNA. Conclusions Neither elimination of GCN5, nor simultaneous inhibition of GCN5 and its homolog PCAF improved skeletal muscle mitochondrial content under normal or HFD-fed conditions. Despite this, GCN5 may play a role in regulating macronutrient preference by regulating Pdk4 content. Thus, HFD/macronutrient excess revealed novel roles of GCN5 in skeletal muscle. Highlights – Skeletal muscle specific elimination of Gcn5/Kat2a decreases fat oxidation without 1) preventing high-fat diet induced weight gain, 2) improving whole body glucose handling, or 3) improving skeletal muscle mitochondrial content. – Inhibition of the GCN5 and PCAF bromodomains and Gcn5 ablation decreases expression of Pdk4 . – Expression of Kat2b increases with Gcn5 elimination in skeletal muscle. – Inhibition of the GCN5 and PCAF bromodomains do not result in increased skeletal muscle mitochondrial content.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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