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Enregistrement W4307459871 · doi:10.1101/2022.10.21.513317

Phosphatidylglycerol is the lipid donor for synthesis of phospholipid-linked enterobacterial common antigen

2022· preprint· en· W4307459871 sur OpenAlexfundno aff
Kinsey N. Morris, Angela M. Mitchell

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaMcGovern Medical School
Mots-clésPhosphatidylglycerolCardiolipinDiacylglycerol kinasePhospholipidBiochemistryEscherichia coliBacterial outer membraneBiosynthesisLipid APhosphatidylethanolamineChemistryPhosphodiester bondBiologyLipopolysaccharideMembranePhosphatidylcholinePhosphorylationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The gram-negative outer membrane (OM) is an asymmetric bilayer with phospholipids in its inner leaflet and mainly lipopolysaccharide (LPS) in its outer leaflet and is largely impermeable to many antibiotics. In Enterobacterales (e.g., Escherichia, Salmonella, Klebsiella, Yersinia ), the outer leaflet of the OM also contains phosphoglyceride-linked enterobacterial common antigen (ECA PG ). This molecule consists of the conserved ECA carbohydrate linked to diacylglycerol-phosphate (DAG-P) through a phosphodiester bond. ECA PG contributes to the OM permeability barrier and modeling suggests that it may alter the packing of LPS molecules in the OM. Here, we investigate, in Escherichia coli K-12, the reaction synthesizing ECA PG from ECA precursor linked to an isoprenoid carrier to identify the lipid donor that provides the DAG-P moiety to ECA PG . Through overexpression of phospholipid biosynthesis genes, we observed alterations expected to increase levels of phosphatidylglycerol (PG) increased synthesis of ECAPG, whereas alterations expected to decrease levels of PG decreased synthesis of ECA PG . We discovered depletion of PG levels in strains that could synthesize ECA PG , but not other forms of ECA, causes additional growth defects, likely due to the buildup of ECA precursor on the isoprenoid carrier inhibiting peptidoglycan biosynthesis. Our results demonstrate ECAPG can be synthesized in the absence of the other major phospholipids (phosphatidylethanolamine and cardiolipin). Overall, these results conclusively demonstrate PG is the lipid donor for the synthesis of ECA PG and provide a key insight into the reaction producing ECA PG . In addition, these results provide an interesting parallel to lipoprotein acylation, which also uses PG as its DAG donor. IMPORTANCE The outer membrane of gram-negative bacteria is a permeability barrier that prevents the entry of many antibiotics into the cell. However, the pathways responsible for outer membrane biogenesis are potential targets for small molecule development. Here, we investigate the synthesis of a form of enterobacterial common antigen (ECA), ECA PG , found in the outer membrane of Enterobacterales such as Escherichia, Salmonella, Klebsiella , and Yersinia . ECA PG consists of the conserved ECA carbohydrate unit linked to diacylglycerol-phosphate—ECA is the headgroup of a phospholipid. The details of the reaction forming this molecule from ECA linked to an isoprenoid carrier are unknown. We determined that the lipid donor that provides the phospholipid moiety to ECA PG is phosphatidylglycerol. Understanding the synthesis of outer membrane constituents such as ECA PG provides the opportunity for the development of molecules to increase outer membrane permeability, expanding the antibiotics available to treat gram-negative infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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